Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dkk4Q8VEJ3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dkk4Q8VEJ3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dkk4Q8VEJ3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dkk4Q8VEJ3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dkk4Q8VEJ3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dkk4Q8VEJ3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dkk4Q8VEJ3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dkk4Q8VEJ3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dkk4Q8VEJ3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Dkk4Q8VEJ3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Dkk4Q8VEJ3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Dkk4Q8VEJ3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Dkk4Q8VEJ3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Dkk4Q8VEJ3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Dkk4Q8VEJ3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Dkk4Q8VEJ3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Dkk4Q8VEJ3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Dkk4Q8VEJ3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Dkk4Q8VEJ3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Dkk4Q8VEJ3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Dkk4Q8VEJ3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Dkk4Q8VEJ3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Dkk4Q8VEJ3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Dkk4Q8VEJ3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Dkk4Q8VEJ3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Dkk4Q8VEJ3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Dkk4Q8VEJ3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Dkk4Q8VEJ3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Dkk4Q8VEJ3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Dkk4Q8VEJ3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Dkk4Q8VEJ3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Dkk4Q8VEJ3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Dkk4Q8VEJ3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Dkk4Q8VEJ3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Dkk4Q8VEJ3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Dkk4Q8VEJ3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Dkk4Q8VEJ3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Dkk4Q8VEJ3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Dkk4Q8VEJ3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Dkk4Q8VEJ3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Dkk4Q8VEJ3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Dkk4Q8VEJ3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Dkk4Q8VEJ3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Dkk4Q8VEJ3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Dkk4Q8VEJ3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Dkk4Q8VEJ3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Dkk4Q8VEJ3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Dkk4Q8VEJ3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Dkk4Q8VEJ3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Dkk4Q8VEJ3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Dkk4Q8VEJ3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Dkk4Q8VEJ3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Dkk4Q8VEJ3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Dkk4Q8VEJ3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Dkk4Q8VEJ3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Dkk4Q8VEJ3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Dkk4Q8VEJ3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Dkk4Q8VEJ3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Dkk4Q8VEJ3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Dkk4Q8VEJ3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Dkk4Q8VEJ3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Dkk4Q8VEJ3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Dkk4Q8VEJ3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Dkk4Q8VEJ3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Dkk4Q8VEJ3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Dkk4Q8VEJ3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Dkk4Q8VEJ3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Dkk4Q8VEJ3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Dkk4Q8VEJ3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Dkk4Q8VEJ3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Dkk4Q8VEJ3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Dkk4Q8VEJ3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Dkk4Q8VEJ3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Dkk4Q8VEJ3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Dkk4Q8VEJ3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Dkk4Q8VEJ3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Dkk4Q8VEJ3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Dkk4Q8VEJ3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Dkk4Q8VEJ3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dkk4Q8VEJ3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dkk4Q8VEJ3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dkk4Q8VEJ3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dkk4Q8VEJ3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dkk4Q8VEJ3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dkk4Q8VEJ3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dkk4Q8VEJ3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dkk4Q8VEJ3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dkk4Q8VEJ3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dkk4Q8VEJ3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dkk4Q8VEJ3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dkk4Q8VEJ3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dkk4Q8VEJ3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dkk4Q8VEJ3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dkk4Q8VEJ3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dkk4Q8VEJ3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dkk4Q8VEJ3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dkk4Q8VEJ3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dkk4Q8VEJ3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Dkk4Q8VEJ3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms