Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS7

Cep57l1, Centrosomal protein CEP57L1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep57l1Q8VDS7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cep57l1Q8VDS7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cep57l1Q8VDS7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cep57l1Q8VDS7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cep57l1Q8VDS7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cep57l1Q8VDS7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cep57l1Q8VDS7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cep57l1Q8VDS7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cep57l1Q8VDS7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cep57l1Q8VDS7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cep57l1Q8VDS7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cep57l1Q8VDS7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cep57l1Q8VDS7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cep57l1Q8VDS7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cep57l1Q8VDS7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cep57l1Q8VDS7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cep57l1Q8VDS7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cep57l1Q8VDS7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cep57l1Q8VDS7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cep57l1Q8VDS7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cep57l1Q8VDS7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cep57l1Q8VDS7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cep57l1Q8VDS7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cep57l1Q8VDS7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cep57l1Q8VDS7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cep57l1Q8VDS7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cep57l1Q8VDS7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cep57l1Q8VDS7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cep57l1Q8VDS7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cep57l1Q8VDS7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cep57l1Q8VDS7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cep57l1Q8VDS7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cep57l1Q8VDS7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cep57l1Q8VDS7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cep57l1Q8VDS7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cep57l1Q8VDS7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cep57l1Q8VDS7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cep57l1Q8VDS7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cep57l1Q8VDS7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cep57l1Q8VDS7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cep57l1Q8VDS7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cep57l1Q8VDS7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cep57l1Q8VDS7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cep57l1Q8VDS7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cep57l1Q8VDS7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cep57l1Q8VDS7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cep57l1Q8VDS7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cep57l1Q8VDS7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cep57l1Q8VDS7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cep57l1Q8VDS7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cep57l1Q8VDS7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cep57l1Q8VDS7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cep57l1Q8VDS7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cep57l1Q8VDS7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cep57l1Q8VDS7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cep57l1Q8VDS7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cep57l1Q8VDS7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cep57l1Q8VDS7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cep57l1Q8VDS7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cep57l1Q8VDS7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cep57l1Q8VDS7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cep57l1Q8VDS7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cep57l1Q8VDS7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cep57l1Q8VDS7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cep57l1Q8VDS7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cep57l1Q8VDS7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cep57l1Q8VDS7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cep57l1Q8VDS7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cep57l1Q8VDS7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cep57l1Q8VDS7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cep57l1Q8VDS7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cep57l1Q8VDS7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cep57l1Q8VDS7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cep57l1Q8VDS7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Cep57l1Q8VDS7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cep57l1Q8VDS7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cep57l1Q8VDS7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cep57l1Q8VDS7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cep57l1Q8VDS7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cep57l1Q8VDS7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cep57l1Q8VDS7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cep57l1Q8VDS7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cep57l1Q8VDS7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cep57l1Q8VDS7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cep57l1Q8VDS7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cep57l1Q8VDS7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cep57l1Q8VDS7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cep57l1Q8VDS7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cep57l1Q8VDS7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cep57l1Q8VDS7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cep57l1Q8VDS7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cep57l1Q8VDS7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cep57l1Q8VDS7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cep57l1Q8VDS7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cep57l1Q8VDS7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cep57l1Q8VDS7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cep57l1Q8VDS7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cep57l1Q8VDS7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cep57l1Q8VDS7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cep57l1Q8VDS7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.3 ms