Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDG3

Parn, Poly(A)-specific ribonuclease PARN, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParnQ8VDG3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ParnQ8VDG3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ParnQ8VDG3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ParnQ8VDG3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ParnQ8VDG3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ParnQ8VDG3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ParnQ8VDG3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ParnQ8VDG3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ParnQ8VDG3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ParnQ8VDG3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ParnQ8VDG3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ParnQ8VDG3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ParnQ8VDG3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ParnQ8VDG3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ParnQ8VDG3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ParnQ8VDG3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ParnQ8VDG3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ParnQ8VDG3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ParnQ8VDG3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ParnQ8VDG3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ParnQ8VDG3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ParnQ8VDG3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ParnQ8VDG3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ParnQ8VDG3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ParnQ8VDG3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ParnQ8VDG3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ParnQ8VDG3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ParnQ8VDG3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ParnQ8VDG3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ParnQ8VDG3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ParnQ8VDG3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ParnQ8VDG3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ParnQ8VDG3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ParnQ8VDG3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ParnQ8VDG3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ParnQ8VDG3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ParnQ8VDG3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ParnQ8VDG3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ParnQ8VDG3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ParnQ8VDG3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ParnQ8VDG3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ParnQ8VDG3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ParnQ8VDG3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ParnQ8VDG3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ParnQ8VDG3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ParnQ8VDG3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ParnQ8VDG3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ParnQ8VDG3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ParnQ8VDG3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ParnQ8VDG3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ParnQ8VDG3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ParnQ8VDG3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ParnQ8VDG3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ParnQ8VDG3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ParnQ8VDG3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ParnQ8VDG3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ParnQ8VDG3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ParnQ8VDG3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ParnQ8VDG3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ParnQ8VDG3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ParnQ8VDG3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ParnQ8VDG3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ParnQ8VDG3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ParnQ8VDG3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ParnQ8VDG3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ParnQ8VDG3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ParnQ8VDG3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ParnQ8VDG3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ParnQ8VDG3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ParnQ8VDG3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ParnQ8VDG3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ParnQ8VDG3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ParnQ8VDG3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ParnQ8VDG3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ParnQ8VDG3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ParnQ8VDG3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ParnQ8VDG3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ParnQ8VDG3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ParnQ8VDG3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ParnQ8VDG3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ParnQ8VDG3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ParnQ8VDG3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ParnQ8VDG3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ParnQ8VDG3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ParnQ8VDG3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ParnQ8VDG3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ParnQ8VDG3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ParnQ8VDG3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ParnQ8VDG3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ParnQ8VDG3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ParnQ8VDG3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ParnQ8VDG3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ParnQ8VDG3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ParnQ8VDG3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ParnQ8VDG3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ParnQ8VDG3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ParnQ8VDG3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ParnQ8VDG3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ParnQ8VDG3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ParnQ8VDG3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms