Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ttc8Q8VD72 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttc8Q8VD72 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttc8Q8VD72 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttc8Q8VD72 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttc8Q8VD72 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttc8Q8VD72 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ttc8Q8VD72 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ttc8Q8VD72 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ttc8Q8VD72 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ttc8Q8VD72 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ttc8Q8VD72 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ttc8Q8VD72 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ttc8Q8VD72 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ttc8Q8VD72 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ttc8Q8VD72 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ttc8Q8VD72 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ttc8Q8VD72 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ttc8Q8VD72 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ttc8Q8VD72 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ttc8Q8VD72 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ttc8Q8VD72 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ttc8Q8VD72 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ttc8Q8VD72 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc8Q8VD72 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc8Q8VD72 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc8Q8VD72 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc8Q8VD72 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc8Q8VD72 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc8Q8VD72 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc8Q8VD72 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc8Q8VD72 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc8Q8VD72 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc8Q8VD72 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc8Q8VD72 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc8Q8VD72 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc8Q8VD72 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc8Q8VD72 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc8Q8VD72 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc8Q8VD72 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc8Q8VD72 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ttc8Q8VD72 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ttc8Q8VD72 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ttc8Q8VD72 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ttc8Q8VD72 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ttc8Q8VD72 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ttc8Q8VD72 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc8Q8VD72 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc8Q8VD72 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc8Q8VD72 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc8Q8VD72 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc8Q8VD72 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc8Q8VD72 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc8Q8VD72 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc8Q8VD72 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc8Q8VD72 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc8Q8VD72 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc8Q8VD72 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc8Q8VD72 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc8Q8VD72 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc8Q8VD72 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc8Q8VD72 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc8Q8VD72 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc8Q8VD72 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc8Q8VD72 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc8Q8VD72 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc8Q8VD72 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc8Q8VD72 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttc8Q8VD72 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttc8Q8VD72 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttc8Q8VD72 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttc8Q8VD72 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttc8Q8VD72 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttc8Q8VD72 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttc8Q8VD72 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttc8Q8VD72 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttc8Q8VD72 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ttc8Q8VD72 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ttc8Q8VD72 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ttc8Q8VD72 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ttc8Q8VD72 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ttc8Q8VD72 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ttc8Q8VD72 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttc8Q8VD72 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttc8Q8VD72 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttc8Q8VD72 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttc8Q8VD72 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ttc8Q8VD72 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ttc8Q8VD72 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ttc8Q8VD72 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ttc8Q8VD72 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ttc8Q8VD72 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ttc8Q8VD72 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ttc8Q8VD72 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttc8Q8VD72 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttc8Q8VD72 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttc8Q8VD72 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttc8Q8VD72 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttc8Q8VD72 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttc8Q8VD72 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms