Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ApobrQ8VBT6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ApobrQ8VBT6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ApobrQ8VBT6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ApobrQ8VBT6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ApobrQ8VBT6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ApobrQ8VBT6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ApobrQ8VBT6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ApobrQ8VBT6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ApobrQ8VBT6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ApobrQ8VBT6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ApobrQ8VBT6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ApobrQ8VBT6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ApobrQ8VBT6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ApobrQ8VBT6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ApobrQ8VBT6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ApobrQ8VBT6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ApobrQ8VBT6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ApobrQ8VBT6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ApobrQ8VBT6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ApobrQ8VBT6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ApobrQ8VBT6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ApobrQ8VBT6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ApobrQ8VBT6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ApobrQ8VBT6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ApobrQ8VBT6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ApobrQ8VBT6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ApobrQ8VBT6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ApobrQ8VBT6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ApobrQ8VBT6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ApobrQ8VBT6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ApobrQ8VBT6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ApobrQ8VBT6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ApobrQ8VBT6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ApobrQ8VBT6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ApobrQ8VBT6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ApobrQ8VBT6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ApobrQ8VBT6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ApobrQ8VBT6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ApobrQ8VBT6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ApobrQ8VBT6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ApobrQ8VBT6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ApobrQ8VBT6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ApobrQ8VBT6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ApobrQ8VBT6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ApobrQ8VBT6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ApobrQ8VBT6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ApobrQ8VBT6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ApobrQ8VBT6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ApobrQ8VBT6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ApobrQ8VBT6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ApobrQ8VBT6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ApobrQ8VBT6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ApobrQ8VBT6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ApobrQ8VBT6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ApobrQ8VBT6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ApobrQ8VBT6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ApobrQ8VBT6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ApobrQ8VBT6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ApobrQ8VBT6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ApobrQ8VBT6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ApobrQ8VBT6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ApobrQ8VBT6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ApobrQ8VBT6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ApobrQ8VBT6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ApobrQ8VBT6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ApobrQ8VBT6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ApobrQ8VBT6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ApobrQ8VBT6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ApobrQ8VBT6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ApobrQ8VBT6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ApobrQ8VBT6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ApobrQ8VBT6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ApobrQ8VBT6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ApobrQ8VBT6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ApobrQ8VBT6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ApobrQ8VBT6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ApobrQ8VBT6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ApobrQ8VBT6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ApobrQ8VBT6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ApobrQ8VBT6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ApobrQ8VBT6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ApobrQ8VBT6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ApobrQ8VBT6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ApobrQ8VBT6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ApobrQ8VBT6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ApobrQ8VBT6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ApobrQ8VBT6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ApobrQ8VBT6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ApobrQ8VBT6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ApobrQ8VBT6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ApobrQ8VBT6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ApobrQ8VBT6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ApobrQ8VBT6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ApobrQ8VBT6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ApobrQ8VBT6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ApobrQ8VBT6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ApobrQ8VBT6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ApobrQ8VBT6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ApobrQ8VBT6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111 ms