Protein–RNA interactions for Protein: Q8K221

Arfip2, Arfaptin-2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip2Q8K221 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Arfip2Q8K221 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arfip2Q8K221 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arfip2Q8K221 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arfip2Q8K221 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arfip2Q8K221 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arfip2Q8K221 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arfip2Q8K221 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arfip2Q8K221 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arfip2Q8K221 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arfip2Q8K221 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arfip2Q8K221 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Arfip2Q8K221 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Arfip2Q8K221 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Arfip2Q8K221 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Arfip2Q8K221 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Arfip2Q8K221 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arfip2Q8K221 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arfip2Q8K221 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arfip2Q8K221 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arfip2Q8K221 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arfip2Q8K221 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arfip2Q8K221 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arfip2Q8K221 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arfip2Q8K221 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arfip2Q8K221 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Arfip2Q8K221 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arfip2Q8K221 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Arfip2Q8K221 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arfip2Q8K221 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arfip2Q8K221 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arfip2Q8K221 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arfip2Q8K221 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arfip2Q8K221 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arfip2Q8K221 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arfip2Q8K221 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arfip2Q8K221 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Arfip2Q8K221 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Arfip2Q8K221 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arfip2Q8K221 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arfip2Q8K221 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arfip2Q8K221 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arfip2Q8K221 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arfip2Q8K221 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arfip2Q8K221 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arfip2Q8K221 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arfip2Q8K221 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arfip2Q8K221 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arfip2Q8K221 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arfip2Q8K221 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arfip2Q8K221 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arfip2Q8K221 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arfip2Q8K221 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Arfip2Q8K221 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Arfip2Q8K221 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Arfip2Q8K221 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Arfip2Q8K221 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Arfip2Q8K221 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Arfip2Q8K221 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Arfip2Q8K221 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Arfip2Q8K221 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Arfip2Q8K221 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arfip2Q8K221 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arfip2Q8K221 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arfip2Q8K221 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arfip2Q8K221 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arfip2Q8K221 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arfip2Q8K221 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arfip2Q8K221 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arfip2Q8K221 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arfip2Q8K221 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arfip2Q8K221 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arfip2Q8K221 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arfip2Q8K221 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Arfip2Q8K221 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Arfip2Q8K221 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Arfip2Q8K221 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arfip2Q8K221 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arfip2Q8K221 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arfip2Q8K221 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arfip2Q8K221 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arfip2Q8K221 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arfip2Q8K221 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arfip2Q8K221 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arfip2Q8K221 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arfip2Q8K221 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arfip2Q8K221 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arfip2Q8K221 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arfip2Q8K221 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arfip2Q8K221 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arfip2Q8K221 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arfip2Q8K221 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arfip2Q8K221 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arfip2Q8K221 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arfip2Q8K221 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arfip2Q8K221 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arfip2Q8K221 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arfip2Q8K221 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arfip2Q8K221 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arfip2Q8K221 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms