Protein–RNA interactions for Protein: Q8K168

1700001C19Rik, RIKEN cDNA 1700001C19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001C19RikQ8K168 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700001C19RikQ8K168 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700001C19RikQ8K168 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700001C19RikQ8K168 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700001C19RikQ8K168 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700001C19RikQ8K168 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
1700001C19RikQ8K168 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700001C19RikQ8K168 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700001C19RikQ8K168 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700001C19RikQ8K168 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700001C19RikQ8K168 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700001C19RikQ8K168 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700001C19RikQ8K168 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700001C19RikQ8K168 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
1700001C19RikQ8K168 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700001C19RikQ8K168 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700001C19RikQ8K168 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700001C19RikQ8K168 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700001C19RikQ8K168 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700001C19RikQ8K168 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700001C19RikQ8K168 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700001C19RikQ8K168 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700001C19RikQ8K168 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
1700001C19RikQ8K168 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
1700001C19RikQ8K168 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
1700001C19RikQ8K168 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
1700001C19RikQ8K168 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
1700001C19RikQ8K168 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
1700001C19RikQ8K168 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700001C19RikQ8K168 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700001C19RikQ8K168 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700001C19RikQ8K168 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700001C19RikQ8K168 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700001C19RikQ8K168 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700001C19RikQ8K168 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700001C19RikQ8K168 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700001C19RikQ8K168 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700001C19RikQ8K168 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700001C19RikQ8K168 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
1700001C19RikQ8K168 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
1700001C19RikQ8K168 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
1700001C19RikQ8K168 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
1700001C19RikQ8K168 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
1700001C19RikQ8K168 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
1700001C19RikQ8K168 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
1700001C19RikQ8K168 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
1700001C19RikQ8K168 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
1700001C19RikQ8K168 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
1700001C19RikQ8K168 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
1700001C19RikQ8K168 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
1700001C19RikQ8K168 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
1700001C19RikQ8K168 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
1700001C19RikQ8K168 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
1700001C19RikQ8K168 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
1700001C19RikQ8K168 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
1700001C19RikQ8K168 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
1700001C19RikQ8K168 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
1700001C19RikQ8K168 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
1700001C19RikQ8K168 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
1700001C19RikQ8K168 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
1700001C19RikQ8K168 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
1700001C19RikQ8K168 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
1700001C19RikQ8K168 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
1700001C19RikQ8K168 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
1700001C19RikQ8K168 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
1700001C19RikQ8K168 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
1700001C19RikQ8K168 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
1700001C19RikQ8K168 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
1700001C19RikQ8K168 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
1700001C19RikQ8K168 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
1700001C19RikQ8K168 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
1700001C19RikQ8K168 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
1700001C19RikQ8K168 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
1700001C19RikQ8K168 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
1700001C19RikQ8K168 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
1700001C19RikQ8K168 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
1700001C19RikQ8K168 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
1700001C19RikQ8K168 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
1700001C19RikQ8K168 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
1700001C19RikQ8K168 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
1700001C19RikQ8K168 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
1700001C19RikQ8K168 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
1700001C19RikQ8K168 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
1700001C19RikQ8K168 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
1700001C19RikQ8K168 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
1700001C19RikQ8K168 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
1700001C19RikQ8K168 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
1700001C19RikQ8K168 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
1700001C19RikQ8K168 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
1700001C19RikQ8K168 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
1700001C19RikQ8K168 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
1700001C19RikQ8K168 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
1700001C19RikQ8K168 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
1700001C19RikQ8K168 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
1700001C19RikQ8K168 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
1700001C19RikQ8K168 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
1700001C19RikQ8K168 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
1700001C19RikQ8K168 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
1700001C19RikQ8K168 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
1700001C19RikQ8K168 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms