Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0F1

Tbc1d23, TBC1 domain family member 23, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d23Q8K0F1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tbc1d23Q8K0F1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tbc1d23Q8K0F1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tbc1d23Q8K0F1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tbc1d23Q8K0F1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tbc1d23Q8K0F1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tbc1d23Q8K0F1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tbc1d23Q8K0F1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tbc1d23Q8K0F1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tbc1d23Q8K0F1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tbc1d23Q8K0F1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tbc1d23Q8K0F1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tbc1d23Q8K0F1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tbc1d23Q8K0F1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tbc1d23Q8K0F1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tbc1d23Q8K0F1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tbc1d23Q8K0F1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tbc1d23Q8K0F1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tbc1d23Q8K0F1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Tbc1d23Q8K0F1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tbc1d23Q8K0F1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tbc1d23Q8K0F1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tbc1d23Q8K0F1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tbc1d23Q8K0F1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tbc1d23Q8K0F1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tbc1d23Q8K0F1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Tbc1d23Q8K0F1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tbc1d23Q8K0F1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tbc1d23Q8K0F1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tbc1d23Q8K0F1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tbc1d23Q8K0F1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tbc1d23Q8K0F1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tbc1d23Q8K0F1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tbc1d23Q8K0F1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tbc1d23Q8K0F1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tbc1d23Q8K0F1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Tbc1d23Q8K0F1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tbc1d23Q8K0F1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tbc1d23Q8K0F1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tbc1d23Q8K0F1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tbc1d23Q8K0F1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tbc1d23Q8K0F1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tbc1d23Q8K0F1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tbc1d23Q8K0F1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tbc1d23Q8K0F1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tbc1d23Q8K0F1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tbc1d23Q8K0F1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Tbc1d23Q8K0F1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tbc1d23Q8K0F1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tbc1d23Q8K0F1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tbc1d23Q8K0F1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tbc1d23Q8K0F1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tbc1d23Q8K0F1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tbc1d23Q8K0F1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tbc1d23Q8K0F1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tbc1d23Q8K0F1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tbc1d23Q8K0F1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tbc1d23Q8K0F1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tbc1d23Q8K0F1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tbc1d23Q8K0F1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tbc1d23Q8K0F1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Tbc1d23Q8K0F1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tbc1d23Q8K0F1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tbc1d23Q8K0F1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tbc1d23Q8K0F1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tbc1d23Q8K0F1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tbc1d23Q8K0F1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tbc1d23Q8K0F1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tbc1d23Q8K0F1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tbc1d23Q8K0F1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tbc1d23Q8K0F1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tbc1d23Q8K0F1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tbc1d23Q8K0F1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tbc1d23Q8K0F1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tbc1d23Q8K0F1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Tbc1d23Q8K0F1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tbc1d23Q8K0F1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tbc1d23Q8K0F1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tbc1d23Q8K0F1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tbc1d23Q8K0F1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Tbc1d23Q8K0F1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tbc1d23Q8K0F1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tbc1d23Q8K0F1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tbc1d23Q8K0F1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tbc1d23Q8K0F1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tbc1d23Q8K0F1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tbc1d23Q8K0F1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tbc1d23Q8K0F1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tbc1d23Q8K0F1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tbc1d23Q8K0F1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tbc1d23Q8K0F1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tbc1d23Q8K0F1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tbc1d23Q8K0F1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tbc1d23Q8K0F1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tbc1d23Q8K0F1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Tbc1d23Q8K0F1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tbc1d23Q8K0F1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tbc1d23Q8K0F1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tbc1d23Q8K0F1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tbc1d23Q8K0F1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms