Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkn3Q8K045 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkn3Q8K045 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkn3Q8K045 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkn3Q8K045 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkn3Q8K045 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkn3Q8K045 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkn3Q8K045 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkn3Q8K045 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkn3Q8K045 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkn3Q8K045 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkn3Q8K045 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkn3Q8K045 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkn3Q8K045 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkn3Q8K045 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkn3Q8K045 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkn3Q8K045 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkn3Q8K045 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkn3Q8K045 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkn3Q8K045 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkn3Q8K045 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkn3Q8K045 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkn3Q8K045 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkn3Q8K045 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkn3Q8K045 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Pkn3Q8K045 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pkn3Q8K045 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pkn3Q8K045 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pkn3Q8K045 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkn3Q8K045 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkn3Q8K045 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkn3Q8K045 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkn3Q8K045 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkn3Q8K045 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkn3Q8K045 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkn3Q8K045 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkn3Q8K045 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkn3Q8K045 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkn3Q8K045 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkn3Q8K045 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkn3Q8K045 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkn3Q8K045 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkn3Q8K045 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkn3Q8K045 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkn3Q8K045 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkn3Q8K045 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkn3Q8K045 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkn3Q8K045 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkn3Q8K045 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkn3Q8K045 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkn3Q8K045 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkn3Q8K045 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkn3Q8K045 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkn3Q8K045 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkn3Q8K045 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkn3Q8K045 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkn3Q8K045 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkn3Q8K045 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkn3Q8K045 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkn3Q8K045 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pkn3Q8K045 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pkn3Q8K045 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pkn3Q8K045 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pkn3Q8K045 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pkn3Q8K045 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pkn3Q8K045 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pkn3Q8K045 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pkn3Q8K045 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pkn3Q8K045 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pkn3Q8K045 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Pkn3Q8K045 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pkn3Q8K045 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pkn3Q8K045 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pkn3Q8K045 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pkn3Q8K045 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pkn3Q8K045 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pkn3Q8K045 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pkn3Q8K045 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pkn3Q8K045 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkn3Q8K045 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkn3Q8K045 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkn3Q8K045 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkn3Q8K045 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkn3Q8K045 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkn3Q8K045 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkn3Q8K045 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkn3Q8K045 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkn3Q8K045 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkn3Q8K045 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkn3Q8K045 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkn3Q8K045 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkn3Q8K045 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkn3Q8K045 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkn3Q8K045 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkn3Q8K045 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkn3Q8K045 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkn3Q8K045 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkn3Q8K045 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkn3Q8K045 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkn3Q8K045 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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