Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Afg3l2Q8JZQ2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Afg3l2Q8JZQ2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Afg3l2Q8JZQ2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Afg3l2Q8JZQ2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Afg3l2Q8JZQ2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Afg3l2Q8JZQ2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Afg3l2Q8JZQ2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Afg3l2Q8JZQ2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Afg3l2Q8JZQ2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Afg3l2Q8JZQ2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Afg3l2Q8JZQ2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Afg3l2Q8JZQ2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Afg3l2Q8JZQ2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Afg3l2Q8JZQ2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Afg3l2Q8JZQ2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Afg3l2Q8JZQ2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Afg3l2Q8JZQ2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Afg3l2Q8JZQ2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Afg3l2Q8JZQ2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Afg3l2Q8JZQ2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Afg3l2Q8JZQ2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Afg3l2Q8JZQ2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Afg3l2Q8JZQ2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Afg3l2Q8JZQ2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Afg3l2Q8JZQ2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Afg3l2Q8JZQ2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Afg3l2Q8JZQ2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Afg3l2Q8JZQ2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Afg3l2Q8JZQ2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Afg3l2Q8JZQ2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Afg3l2Q8JZQ2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Afg3l2Q8JZQ2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Afg3l2Q8JZQ2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Afg3l2Q8JZQ2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Afg3l2Q8JZQ2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Afg3l2Q8JZQ2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Afg3l2Q8JZQ2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Afg3l2Q8JZQ2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Afg3l2Q8JZQ2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Afg3l2Q8JZQ2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Afg3l2Q8JZQ2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Afg3l2Q8JZQ2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Afg3l2Q8JZQ2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Afg3l2Q8JZQ2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Afg3l2Q8JZQ2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Afg3l2Q8JZQ2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Afg3l2Q8JZQ2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Afg3l2Q8JZQ2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Afg3l2Q8JZQ2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Afg3l2Q8JZQ2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Afg3l2Q8JZQ2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Afg3l2Q8JZQ2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Afg3l2Q8JZQ2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Afg3l2Q8JZQ2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Afg3l2Q8JZQ2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Afg3l2Q8JZQ2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Afg3l2Q8JZQ2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Afg3l2Q8JZQ2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Afg3l2Q8JZQ2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Afg3l2Q8JZQ2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Afg3l2Q8JZQ2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Afg3l2Q8JZQ2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Afg3l2Q8JZQ2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Afg3l2Q8JZQ2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Afg3l2Q8JZQ2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Afg3l2Q8JZQ2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Afg3l2Q8JZQ2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Afg3l2Q8JZQ2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Afg3l2Q8JZQ2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Afg3l2Q8JZQ2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Afg3l2Q8JZQ2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Afg3l2Q8JZQ2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Afg3l2Q8JZQ2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Afg3l2Q8JZQ2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Afg3l2Q8JZQ2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Afg3l2Q8JZQ2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Afg3l2Q8JZQ2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Afg3l2Q8JZQ2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Afg3l2Q8JZQ2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Afg3l2Q8JZQ2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Afg3l2Q8JZQ2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Afg3l2Q8JZQ2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Afg3l2Q8JZQ2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Afg3l2Q8JZQ2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Afg3l2Q8JZQ2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Afg3l2Q8JZQ2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Afg3l2Q8JZQ2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Afg3l2Q8JZQ2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Afg3l2Q8JZQ2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Afg3l2Q8JZQ2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Afg3l2Q8JZQ2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Afg3l2Q8JZQ2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Afg3l2Q8JZQ2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Afg3l2Q8JZQ2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Afg3l2Q8JZQ2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Afg3l2Q8JZQ2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Afg3l2Q8JZQ2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms