Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trip10Q8CJ53 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trip10Q8CJ53 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trip10Q8CJ53 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trip10Q8CJ53 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trip10Q8CJ53 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trip10Q8CJ53 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trip10Q8CJ53 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trip10Q8CJ53 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trip10Q8CJ53 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trip10Q8CJ53 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trip10Q8CJ53 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trip10Q8CJ53 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trip10Q8CJ53 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trip10Q8CJ53 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trip10Q8CJ53 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trip10Q8CJ53 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trip10Q8CJ53 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trip10Q8CJ53 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trip10Q8CJ53 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trip10Q8CJ53 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trip10Q8CJ53 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trip10Q8CJ53 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trip10Q8CJ53 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trip10Q8CJ53 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Trip10Q8CJ53 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trip10Q8CJ53 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trip10Q8CJ53 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trip10Q8CJ53 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trip10Q8CJ53 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trip10Q8CJ53 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trip10Q8CJ53 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trip10Q8CJ53 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trip10Q8CJ53 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trip10Q8CJ53 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trip10Q8CJ53 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trip10Q8CJ53 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trip10Q8CJ53 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trip10Q8CJ53 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trip10Q8CJ53 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trip10Q8CJ53 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trip10Q8CJ53 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trip10Q8CJ53 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trip10Q8CJ53 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trip10Q8CJ53 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trip10Q8CJ53 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trip10Q8CJ53 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trip10Q8CJ53 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trip10Q8CJ53 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trip10Q8CJ53 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trip10Q8CJ53 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trip10Q8CJ53 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trip10Q8CJ53 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trip10Q8CJ53 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trip10Q8CJ53 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trip10Q8CJ53 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trip10Q8CJ53 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trip10Q8CJ53 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trip10Q8CJ53 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trip10Q8CJ53 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trip10Q8CJ53 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trip10Q8CJ53 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trip10Q8CJ53 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trip10Q8CJ53 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trip10Q8CJ53 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trip10Q8CJ53 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trip10Q8CJ53 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trip10Q8CJ53 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trip10Q8CJ53 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trip10Q8CJ53 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trip10Q8CJ53 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trip10Q8CJ53 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trip10Q8CJ53 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trip10Q8CJ53 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trip10Q8CJ53 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Trip10Q8CJ53 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trip10Q8CJ53 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trip10Q8CJ53 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trip10Q8CJ53 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trip10Q8CJ53 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trip10Q8CJ53 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trip10Q8CJ53 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trip10Q8CJ53 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trip10Q8CJ53 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trip10Q8CJ53 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trip10Q8CJ53 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trip10Q8CJ53 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trip10Q8CJ53 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trip10Q8CJ53 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trip10Q8CJ53 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trip10Q8CJ53 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Trip10Q8CJ53 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trip10Q8CJ53 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trip10Q8CJ53 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trip10Q8CJ53 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trip10Q8CJ53 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trip10Q8CJ53 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trip10Q8CJ53 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trip10Q8CJ53 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trip10Q8CJ53 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms