Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIC2

Nupl2, Nucleoporin-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nupl2Q8CIC2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nupl2Q8CIC2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nupl2Q8CIC2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nupl2Q8CIC2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nupl2Q8CIC2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nupl2Q8CIC2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nupl2Q8CIC2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nupl2Q8CIC2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nupl2Q8CIC2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nupl2Q8CIC2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nupl2Q8CIC2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nupl2Q8CIC2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nupl2Q8CIC2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nupl2Q8CIC2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nupl2Q8CIC2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nupl2Q8CIC2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nupl2Q8CIC2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nupl2Q8CIC2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nupl2Q8CIC2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nupl2Q8CIC2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nupl2Q8CIC2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nupl2Q8CIC2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nupl2Q8CIC2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nupl2Q8CIC2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nupl2Q8CIC2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nupl2Q8CIC2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nupl2Q8CIC2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nupl2Q8CIC2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nupl2Q8CIC2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nupl2Q8CIC2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nupl2Q8CIC2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nupl2Q8CIC2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nupl2Q8CIC2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nupl2Q8CIC2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nupl2Q8CIC2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nupl2Q8CIC2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nupl2Q8CIC2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nupl2Q8CIC2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nupl2Q8CIC2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nupl2Q8CIC2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nupl2Q8CIC2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nupl2Q8CIC2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nupl2Q8CIC2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nupl2Q8CIC2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nupl2Q8CIC2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nupl2Q8CIC2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nupl2Q8CIC2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nupl2Q8CIC2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nupl2Q8CIC2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nupl2Q8CIC2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nupl2Q8CIC2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nupl2Q8CIC2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nupl2Q8CIC2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nupl2Q8CIC2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nupl2Q8CIC2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nupl2Q8CIC2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nupl2Q8CIC2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nupl2Q8CIC2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nupl2Q8CIC2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nupl2Q8CIC2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nupl2Q8CIC2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nupl2Q8CIC2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nupl2Q8CIC2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nupl2Q8CIC2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nupl2Q8CIC2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nupl2Q8CIC2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nupl2Q8CIC2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nupl2Q8CIC2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nupl2Q8CIC2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nupl2Q8CIC2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nupl2Q8CIC2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nupl2Q8CIC2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nupl2Q8CIC2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nupl2Q8CIC2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nupl2Q8CIC2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nupl2Q8CIC2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nupl2Q8CIC2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nupl2Q8CIC2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nupl2Q8CIC2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Nupl2Q8CIC2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms