Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD19

Lancl3, LanC-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl3Q8CD19 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lancl3Q8CD19 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lancl3Q8CD19 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lancl3Q8CD19 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lancl3Q8CD19 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lancl3Q8CD19 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lancl3Q8CD19 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lancl3Q8CD19 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lancl3Q8CD19 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Lancl3Q8CD19 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lancl3Q8CD19 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lancl3Q8CD19 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lancl3Q8CD19 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lancl3Q8CD19 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lancl3Q8CD19 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lancl3Q8CD19 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lancl3Q8CD19 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lancl3Q8CD19 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lancl3Q8CD19 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lancl3Q8CD19 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lancl3Q8CD19 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lancl3Q8CD19 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lancl3Q8CD19 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lancl3Q8CD19 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lancl3Q8CD19 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lancl3Q8CD19 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lancl3Q8CD19 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lancl3Q8CD19 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lancl3Q8CD19 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lancl3Q8CD19 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lancl3Q8CD19 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lancl3Q8CD19 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lancl3Q8CD19 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lancl3Q8CD19 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lancl3Q8CD19 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lancl3Q8CD19 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lancl3Q8CD19 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lancl3Q8CD19 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Lancl3Q8CD19 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lancl3Q8CD19 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lancl3Q8CD19 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lancl3Q8CD19 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lancl3Q8CD19 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms