Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacnb2Q8CC27 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacnb2Q8CC27 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacnb2Q8CC27 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacnb2Q8CC27 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacnb2Q8CC27 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacnb2Q8CC27 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacnb2Q8CC27 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacnb2Q8CC27 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cacnb2Q8CC27 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cacnb2Q8CC27 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacnb2Q8CC27 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacnb2Q8CC27 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacnb2Q8CC27 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacnb2Q8CC27 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacnb2Q8CC27 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacnb2Q8CC27 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacnb2Q8CC27 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacnb2Q8CC27 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacnb2Q8CC27 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacnb2Q8CC27 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacnb2Q8CC27 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacnb2Q8CC27 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacnb2Q8CC27 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacnb2Q8CC27 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacnb2Q8CC27 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacnb2Q8CC27 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacnb2Q8CC27 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacnb2Q8CC27 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacnb2Q8CC27 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacnb2Q8CC27 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacnb2Q8CC27 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacnb2Q8CC27 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacnb2Q8CC27 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacnb2Q8CC27 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacnb2Q8CC27 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacnb2Q8CC27 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacnb2Q8CC27 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacnb2Q8CC27 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacnb2Q8CC27 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacnb2Q8CC27 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacnb2Q8CC27 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacnb2Q8CC27 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacnb2Q8CC27 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacnb2Q8CC27 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacnb2Q8CC27 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacnb2Q8CC27 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacnb2Q8CC27 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacnb2Q8CC27 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacnb2Q8CC27 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacnb2Q8CC27 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacnb2Q8CC27 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cacnb2Q8CC27 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacnb2Q8CC27 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacnb2Q8CC27 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacnb2Q8CC27 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacnb2Q8CC27 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacnb2Q8CC27 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacnb2Q8CC27 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacnb2Q8CC27 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacnb2Q8CC27 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacnb2Q8CC27 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacnb2Q8CC27 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacnb2Q8CC27 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacnb2Q8CC27 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacnb2Q8CC27 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacnb2Q8CC27 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacnb2Q8CC27 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacnb2Q8CC27 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacnb2Q8CC27 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacnb2Q8CC27 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacnb2Q8CC27 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacnb2Q8CC27 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacnb2Q8CC27 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacnb2Q8CC27 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacnb2Q8CC27 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacnb2Q8CC27 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacnb2Q8CC27 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacnb2Q8CC27 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacnb2Q8CC27 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacnb2Q8CC27 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacnb2Q8CC27 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacnb2Q8CC27 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacnb2Q8CC27 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacnb2Q8CC27 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacnb2Q8CC27 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacnb2Q8CC27 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacnb2Q8CC27 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacnb2Q8CC27 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacnb2Q8CC27 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacnb2Q8CC27 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacnb2Q8CC27 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacnb2Q8CC27 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacnb2Q8CC27 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacnb2Q8CC27 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacnb2Q8CC27 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacnb2Q8CC27 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacnb2Q8CC27 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacnb2Q8CC27 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacnb2Q8CC27 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms