Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB19

Phtf2, Putative homeodomain transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf2Q8CB19 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Phtf2Q8CB19 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Phtf2Q8CB19 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Phtf2Q8CB19 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Phtf2Q8CB19 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Phtf2Q8CB19 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Phtf2Q8CB19 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Phtf2Q8CB19 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Phtf2Q8CB19 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Phtf2Q8CB19 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Phtf2Q8CB19 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Phtf2Q8CB19 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Phtf2Q8CB19 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Phtf2Q8CB19 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Phtf2Q8CB19 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Phtf2Q8CB19 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Phtf2Q8CB19 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Phtf2Q8CB19 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Phtf2Q8CB19 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Phtf2Q8CB19 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Phtf2Q8CB19 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Phtf2Q8CB19 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Phtf2Q8CB19 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Phtf2Q8CB19 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Phtf2Q8CB19 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Phtf2Q8CB19 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Phtf2Q8CB19 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phtf2Q8CB19 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Phtf2Q8CB19 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Phtf2Q8CB19 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phtf2Q8CB19 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phtf2Q8CB19 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phtf2Q8CB19 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phtf2Q8CB19 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phtf2Q8CB19 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phtf2Q8CB19 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phtf2Q8CB19 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phtf2Q8CB19 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phtf2Q8CB19 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phtf2Q8CB19 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phtf2Q8CB19 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phtf2Q8CB19 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phtf2Q8CB19 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phtf2Q8CB19 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phtf2Q8CB19 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phtf2Q8CB19 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Phtf2Q8CB19 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Phtf2Q8CB19 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Phtf2Q8CB19 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Phtf2Q8CB19 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Phtf2Q8CB19 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Phtf2Q8CB19 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Phtf2Q8CB19 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Phtf2Q8CB19 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Phtf2Q8CB19 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Phtf2Q8CB19 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Phtf2Q8CB19 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Phtf2Q8CB19 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Phtf2Q8CB19 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Phtf2Q8CB19 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Phtf2Q8CB19 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Phtf2Q8CB19 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Phtf2Q8CB19 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Phtf2Q8CB19 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Phtf2Q8CB19 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Phtf2Q8CB19 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Phtf2Q8CB19 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Phtf2Q8CB19 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Phtf2Q8CB19 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Phtf2Q8CB19 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Phtf2Q8CB19 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Phtf2Q8CB19 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Phtf2Q8CB19 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Phtf2Q8CB19 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phtf2Q8CB19 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phtf2Q8CB19 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phtf2Q8CB19 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phtf2Q8CB19 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phtf2Q8CB19 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phtf2Q8CB19 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phtf2Q8CB19 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phtf2Q8CB19 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Phtf2Q8CB19 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Phtf2Q8CB19 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Phtf2Q8CB19 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Phtf2Q8CB19 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Phtf2Q8CB19 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Phtf2Q8CB19 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Phtf2Q8CB19 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Phtf2Q8CB19 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Phtf2Q8CB19 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Phtf2Q8CB19 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Phtf2Q8CB19 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Phtf2Q8CB19 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Phtf2Q8CB19 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Phtf2Q8CB19 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Phtf2Q8CB19 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Phtf2Q8CB19 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Phtf2Q8CB19 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Phtf2Q8CB19 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms