Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8K3

Srsf12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf12Q8C8K3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf12Q8C8K3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf12Q8C8K3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf12Q8C8K3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf12Q8C8K3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf12Q8C8K3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf12Q8C8K3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf12Q8C8K3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf12Q8C8K3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf12Q8C8K3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf12Q8C8K3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf12Q8C8K3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf12Q8C8K3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf12Q8C8K3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf12Q8C8K3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srsf12Q8C8K3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srsf12Q8C8K3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srsf12Q8C8K3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srsf12Q8C8K3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srsf12Q8C8K3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srsf12Q8C8K3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Srsf12Q8C8K3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Srsf12Q8C8K3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Srsf12Q8C8K3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Srsf12Q8C8K3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Srsf12Q8C8K3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Srsf12Q8C8K3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Srsf12Q8C8K3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf12Q8C8K3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf12Q8C8K3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf12Q8C8K3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf12Q8C8K3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf12Q8C8K3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf12Q8C8K3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf12Q8C8K3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf12Q8C8K3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf12Q8C8K3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf12Q8C8K3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf12Q8C8K3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Srsf12Q8C8K3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Srsf12Q8C8K3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Srsf12Q8C8K3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Srsf12Q8C8K3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Srsf12Q8C8K3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Srsf12Q8C8K3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Srsf12Q8C8K3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Srsf12Q8C8K3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Srsf12Q8C8K3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Srsf12Q8C8K3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Srsf12Q8C8K3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Srsf12Q8C8K3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Srsf12Q8C8K3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Srsf12Q8C8K3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Srsf12Q8C8K3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Srsf12Q8C8K3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Srsf12Q8C8K3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Srsf12Q8C8K3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Srsf12Q8C8K3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Srsf12Q8C8K3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Srsf12Q8C8K3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Srsf12Q8C8K3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Srsf12Q8C8K3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Srsf12Q8C8K3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Srsf12Q8C8K3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Srsf12Q8C8K3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Srsf12Q8C8K3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Srsf12Q8C8K3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Srsf12Q8C8K3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Srsf12Q8C8K3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Srsf12Q8C8K3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Srsf12Q8C8K3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Srsf12Q8C8K3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Srsf12Q8C8K3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Srsf12Q8C8K3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Srsf12Q8C8K3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Srsf12Q8C8K3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Srsf12Q8C8K3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Srsf12Q8C8K3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Srsf12Q8C8K3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Srsf12Q8C8K3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Srsf12Q8C8K3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Srsf12Q8C8K3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Srsf12Q8C8K3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Srsf12Q8C8K3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Srsf12Q8C8K3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Srsf12Q8C8K3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Srsf12Q8C8K3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Srsf12Q8C8K3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Srsf12Q8C8K3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Srsf12Q8C8K3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Srsf12Q8C8K3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Srsf12Q8C8K3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Srsf12Q8C8K3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Srsf12Q8C8K3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Srsf12Q8C8K3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Srsf12Q8C8K3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Srsf12Q8C8K3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Srsf12Q8C8K3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms