Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dclre1bQ8C7W7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dclre1bQ8C7W7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dclre1bQ8C7W7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dclre1bQ8C7W7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dclre1bQ8C7W7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dclre1bQ8C7W7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dclre1bQ8C7W7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Dclre1bQ8C7W7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dclre1bQ8C7W7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dclre1bQ8C7W7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dclre1bQ8C7W7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dclre1bQ8C7W7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dclre1bQ8C7W7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dclre1bQ8C7W7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dclre1bQ8C7W7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dclre1bQ8C7W7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dclre1bQ8C7W7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dclre1bQ8C7W7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Dclre1bQ8C7W7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dclre1bQ8C7W7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dclre1bQ8C7W7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dclre1bQ8C7W7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dclre1bQ8C7W7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dclre1bQ8C7W7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dclre1bQ8C7W7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dclre1bQ8C7W7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dclre1bQ8C7W7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Dclre1bQ8C7W7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dclre1bQ8C7W7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dclre1bQ8C7W7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dclre1bQ8C7W7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dclre1bQ8C7W7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dclre1bQ8C7W7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dclre1bQ8C7W7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dclre1bQ8C7W7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dclre1bQ8C7W7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dclre1bQ8C7W7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dclre1bQ8C7W7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dclre1bQ8C7W7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dclre1bQ8C7W7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dclre1bQ8C7W7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dclre1bQ8C7W7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dclre1bQ8C7W7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dclre1bQ8C7W7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dclre1bQ8C7W7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dclre1bQ8C7W7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dclre1bQ8C7W7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dclre1bQ8C7W7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Dclre1bQ8C7W7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dclre1bQ8C7W7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dclre1bQ8C7W7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dclre1bQ8C7W7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dclre1bQ8C7W7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dclre1bQ8C7W7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dclre1bQ8C7W7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dclre1bQ8C7W7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Dclre1bQ8C7W7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dclre1bQ8C7W7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dclre1bQ8C7W7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dclre1bQ8C7W7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dclre1bQ8C7W7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dclre1bQ8C7W7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dclre1bQ8C7W7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dclre1bQ8C7W7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dclre1bQ8C7W7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dclre1bQ8C7W7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dclre1bQ8C7W7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dclre1bQ8C7W7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dclre1bQ8C7W7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dclre1bQ8C7W7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dclre1bQ8C7W7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dclre1bQ8C7W7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dclre1bQ8C7W7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dclre1bQ8C7W7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dclre1bQ8C7W7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dclre1bQ8C7W7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dclre1bQ8C7W7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Dclre1bQ8C7W7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dclre1bQ8C7W7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dclre1bQ8C7W7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dclre1bQ8C7W7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dclre1bQ8C7W7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dclre1bQ8C7W7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dclre1bQ8C7W7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dclre1bQ8C7W7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dclre1bQ8C7W7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dclre1bQ8C7W7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dclre1bQ8C7W7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dclre1bQ8C7W7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dclre1bQ8C7W7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dclre1bQ8C7W7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dclre1bQ8C7W7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Dclre1bQ8C7W7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Dclre1bQ8C7W7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Dclre1bQ8C7W7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dclre1bQ8C7W7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dclre1bQ8C7W7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Dclre1bQ8C7W7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dclre1bQ8C7W7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.6 ms