Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5V8

Ccdc187, Coiled-coil domain-containing protein 187, mousemouse

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Length 958 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc187Q8C5V8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc187Q8C5V8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc187Q8C5V8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc187Q8C5V8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc187Q8C5V8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc187Q8C5V8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc187Q8C5V8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc187Q8C5V8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc187Q8C5V8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc187Q8C5V8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc187Q8C5V8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc187Q8C5V8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc187Q8C5V8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc187Q8C5V8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc187Q8C5V8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc187Q8C5V8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc187Q8C5V8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc187Q8C5V8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc187Q8C5V8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc187Q8C5V8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc187Q8C5V8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc187Q8C5V8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc187Q8C5V8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc187Q8C5V8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc187Q8C5V8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc187Q8C5V8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc187Q8C5V8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc187Q8C5V8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc187Q8C5V8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc187Q8C5V8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc187Q8C5V8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc187Q8C5V8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc187Q8C5V8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc187Q8C5V8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc187Q8C5V8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc187Q8C5V8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc187Q8C5V8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc187Q8C5V8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc187Q8C5V8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc187Q8C5V8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc187Q8C5V8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc187Q8C5V8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc187Q8C5V8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc187Q8C5V8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc187Q8C5V8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc187Q8C5V8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc187Q8C5V8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc187Q8C5V8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc187Q8C5V8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc187Q8C5V8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc187Q8C5V8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc187Q8C5V8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc187Q8C5V8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc187Q8C5V8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc187Q8C5V8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc187Q8C5V8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc187Q8C5V8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc187Q8C5V8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc187Q8C5V8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc187Q8C5V8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc187Q8C5V8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc187Q8C5V8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc187Q8C5V8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc187Q8C5V8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc187Q8C5V8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc187Q8C5V8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc187Q8C5V8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc187Q8C5V8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc187Q8C5V8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc187Q8C5V8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc187Q8C5V8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc187Q8C5V8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc187Q8C5V8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccdc187Q8C5V8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc187Q8C5V8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc187Q8C5V8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc187Q8C5V8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc187Q8C5V8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc187Q8C5V8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc187Q8C5V8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc187Q8C5V8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc187Q8C5V8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc187Q8C5V8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc187Q8C5V8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc187Q8C5V8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc187Q8C5V8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc187Q8C5V8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc187Q8C5V8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc187Q8C5V8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc187Q8C5V8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc187Q8C5V8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc187Q8C5V8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc187Q8C5V8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc187Q8C5V8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc187Q8C5V8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc187Q8C5V8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc187Q8C5V8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc187Q8C5V8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc187Q8C5V8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc187Q8C5V8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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