Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
4933409G03RikQ8C5U0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
4933409G03RikQ8C5U0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4933409G03RikQ8C5U0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
4933409G03RikQ8C5U0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4933409G03RikQ8C5U0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4933409G03RikQ8C5U0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4933409G03RikQ8C5U0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4933409G03RikQ8C5U0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4933409G03RikQ8C5U0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
4933409G03RikQ8C5U0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4933409G03RikQ8C5U0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4933409G03RikQ8C5U0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4933409G03RikQ8C5U0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4933409G03RikQ8C5U0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4933409G03RikQ8C5U0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4933409G03RikQ8C5U0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4933409G03RikQ8C5U0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4933409G03RikQ8C5U0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
4933409G03RikQ8C5U0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4933409G03RikQ8C5U0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4933409G03RikQ8C5U0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
4933409G03RikQ8C5U0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4933409G03RikQ8C5U0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4933409G03RikQ8C5U0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4933409G03RikQ8C5U0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4933409G03RikQ8C5U0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4933409G03RikQ8C5U0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4933409G03RikQ8C5U0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
4933409G03RikQ8C5U0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4933409G03RikQ8C5U0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4933409G03RikQ8C5U0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4933409G03RikQ8C5U0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
4933409G03RikQ8C5U0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4933409G03RikQ8C5U0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4933409G03RikQ8C5U0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4933409G03RikQ8C5U0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4933409G03RikQ8C5U0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
4933409G03RikQ8C5U0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4933409G03RikQ8C5U0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
4933409G03RikQ8C5U0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4933409G03RikQ8C5U0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4933409G03RikQ8C5U0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
4933409G03RikQ8C5U0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4933409G03RikQ8C5U0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4933409G03RikQ8C5U0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4933409G03RikQ8C5U0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4933409G03RikQ8C5U0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4933409G03RikQ8C5U0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
4933409G03RikQ8C5U0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
4933409G03RikQ8C5U0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4933409G03RikQ8C5U0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4933409G03RikQ8C5U0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4933409G03RikQ8C5U0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4933409G03RikQ8C5U0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4933409G03RikQ8C5U0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
4933409G03RikQ8C5U0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4933409G03RikQ8C5U0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4933409G03RikQ8C5U0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
4933409G03RikQ8C5U0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
4933409G03RikQ8C5U0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
4933409G03RikQ8C5U0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4933409G03RikQ8C5U0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4933409G03RikQ8C5U0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4933409G03RikQ8C5U0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
4933409G03RikQ8C5U0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
4933409G03RikQ8C5U0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
4933409G03RikQ8C5U0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4933409G03RikQ8C5U0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
4933409G03RikQ8C5U0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4933409G03RikQ8C5U0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
4933409G03RikQ8C5U0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4933409G03RikQ8C5U0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
4933409G03RikQ8C5U0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4933409G03RikQ8C5U0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4933409G03RikQ8C5U0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
4933409G03RikQ8C5U0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
4933409G03RikQ8C5U0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4933409G03RikQ8C5U0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4933409G03RikQ8C5U0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4933409G03RikQ8C5U0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
4933409G03RikQ8C5U0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
4933409G03RikQ8C5U0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
4933409G03RikQ8C5U0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4933409G03RikQ8C5U0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4933409G03RikQ8C5U0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4933409G03RikQ8C5U0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
4933409G03RikQ8C5U0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4933409G03RikQ8C5U0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
4933409G03RikQ8C5U0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4933409G03RikQ8C5U0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms