Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cwc22Q8C5N3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cwc22Q8C5N3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cwc22Q8C5N3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cwc22Q8C5N3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cwc22Q8C5N3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cwc22Q8C5N3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cwc22Q8C5N3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cwc22Q8C5N3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cwc22Q8C5N3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cwc22Q8C5N3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cwc22Q8C5N3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cwc22Q8C5N3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cwc22Q8C5N3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cwc22Q8C5N3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cwc22Q8C5N3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cwc22Q8C5N3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cwc22Q8C5N3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cwc22Q8C5N3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cwc22Q8C5N3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cwc22Q8C5N3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cwc22Q8C5N3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cwc22Q8C5N3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cwc22Q8C5N3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cwc22Q8C5N3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cwc22Q8C5N3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cwc22Q8C5N3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cwc22Q8C5N3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cwc22Q8C5N3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cwc22Q8C5N3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cwc22Q8C5N3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Cwc22Q8C5N3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cwc22Q8C5N3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cwc22Q8C5N3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Cwc22Q8C5N3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cwc22Q8C5N3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cwc22Q8C5N3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cwc22Q8C5N3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cwc22Q8C5N3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cwc22Q8C5N3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cwc22Q8C5N3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cwc22Q8C5N3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cwc22Q8C5N3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cwc22Q8C5N3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cwc22Q8C5N3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cwc22Q8C5N3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Cwc22Q8C5N3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Cwc22Q8C5N3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cwc22Q8C5N3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cwc22Q8C5N3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cwc22Q8C5N3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cwc22Q8C5N3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cwc22Q8C5N3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cwc22Q8C5N3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cwc22Q8C5N3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cwc22Q8C5N3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Cwc22Q8C5N3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cwc22Q8C5N3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Cwc22Q8C5N3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cwc22Q8C5N3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cwc22Q8C5N3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cwc22Q8C5N3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cwc22Q8C5N3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cwc22Q8C5N3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Cwc22Q8C5N3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cwc22Q8C5N3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cwc22Q8C5N3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cwc22Q8C5N3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cwc22Q8C5N3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cwc22Q8C5N3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cwc22Q8C5N3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cwc22Q8C5N3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cwc22Q8C5N3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cwc22Q8C5N3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Cwc22Q8C5N3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cwc22Q8C5N3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Cwc22Q8C5N3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cwc22Q8C5N3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cwc22Q8C5N3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cwc22Q8C5N3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cwc22Q8C5N3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cwc22Q8C5N3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cwc22Q8C5N3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cwc22Q8C5N3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cwc22Q8C5N3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Cwc22Q8C5N3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cwc22Q8C5N3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cwc22Q8C5N3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cwc22Q8C5N3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cwc22Q8C5N3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cwc22Q8C5N3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cwc22Q8C5N3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cwc22Q8C5N3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cwc22Q8C5N3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cwc22Q8C5N3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cwc22Q8C5N3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cwc22Q8C5N3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cwc22Q8C5N3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Cwc22Q8C5N3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cwc22Q8C5N3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms