Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tnrc6bQ8BKI2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tnrc6bQ8BKI2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tnrc6bQ8BKI2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tnrc6bQ8BKI2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tnrc6bQ8BKI2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tnrc6bQ8BKI2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tnrc6bQ8BKI2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tnrc6bQ8BKI2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tnrc6bQ8BKI2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tnrc6bQ8BKI2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tnrc6bQ8BKI2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tnrc6bQ8BKI2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tnrc6bQ8BKI2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tnrc6bQ8BKI2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tnrc6bQ8BKI2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tnrc6bQ8BKI2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Tnrc6bQ8BKI2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tnrc6bQ8BKI2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tnrc6bQ8BKI2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tnrc6bQ8BKI2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tnrc6bQ8BKI2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tnrc6bQ8BKI2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tnrc6bQ8BKI2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tnrc6bQ8BKI2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Tnrc6bQ8BKI2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Tnrc6bQ8BKI2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Tnrc6bQ8BKI2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tnrc6bQ8BKI2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tnrc6bQ8BKI2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tnrc6bQ8BKI2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tnrc6bQ8BKI2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tnrc6bQ8BKI2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tnrc6bQ8BKI2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tnrc6bQ8BKI2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tnrc6bQ8BKI2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tnrc6bQ8BKI2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tnrc6bQ8BKI2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tnrc6bQ8BKI2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tnrc6bQ8BKI2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Tnrc6bQ8BKI2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tnrc6bQ8BKI2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tnrc6bQ8BKI2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Tnrc6bQ8BKI2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tnrc6bQ8BKI2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tnrc6bQ8BKI2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Tnrc6bQ8BKI2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tnrc6bQ8BKI2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tnrc6bQ8BKI2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tnrc6bQ8BKI2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tnrc6bQ8BKI2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tnrc6bQ8BKI2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tnrc6bQ8BKI2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tnrc6bQ8BKI2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Tnrc6bQ8BKI2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Tnrc6bQ8BKI2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Tnrc6bQ8BKI2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Tnrc6bQ8BKI2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tnrc6bQ8BKI2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tnrc6bQ8BKI2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tnrc6bQ8BKI2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tnrc6bQ8BKI2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tnrc6bQ8BKI2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tnrc6bQ8BKI2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tnrc6bQ8BKI2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tnrc6bQ8BKI2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tnrc6bQ8BKI2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Tnrc6bQ8BKI2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Tnrc6bQ8BKI2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tnrc6bQ8BKI2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tnrc6bQ8BKI2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tnrc6bQ8BKI2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tnrc6bQ8BKI2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tnrc6bQ8BKI2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tnrc6bQ8BKI2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Tnrc6bQ8BKI2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tnrc6bQ8BKI2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tnrc6bQ8BKI2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tnrc6bQ8BKI2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tnrc6bQ8BKI2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tnrc6bQ8BKI2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tnrc6bQ8BKI2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tnrc6bQ8BKI2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tnrc6bQ8BKI2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tnrc6bQ8BKI2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tnrc6bQ8BKI2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tnrc6bQ8BKI2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Tnrc6bQ8BKI2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tnrc6bQ8BKI2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tnrc6bQ8BKI2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tnrc6bQ8BKI2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tnrc6bQ8BKI2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Tnrc6bQ8BKI2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms