Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp4f39Q8BGU0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp4f39Q8BGU0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp4f39Q8BGU0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp4f39Q8BGU0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp4f39Q8BGU0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp4f39Q8BGU0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp4f39Q8BGU0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp4f39Q8BGU0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp4f39Q8BGU0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp4f39Q8BGU0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp4f39Q8BGU0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp4f39Q8BGU0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp4f39Q8BGU0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp4f39Q8BGU0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp4f39Q8BGU0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp4f39Q8BGU0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp4f39Q8BGU0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp4f39Q8BGU0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp4f39Q8BGU0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp4f39Q8BGU0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp4f39Q8BGU0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp4f39Q8BGU0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp4f39Q8BGU0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp4f39Q8BGU0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp4f39Q8BGU0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp4f39Q8BGU0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp4f39Q8BGU0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp4f39Q8BGU0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp4f39Q8BGU0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp4f39Q8BGU0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp4f39Q8BGU0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp4f39Q8BGU0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp4f39Q8BGU0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp4f39Q8BGU0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp4f39Q8BGU0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp4f39Q8BGU0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp4f39Q8BGU0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp4f39Q8BGU0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp4f39Q8BGU0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp4f39Q8BGU0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp4f39Q8BGU0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp4f39Q8BGU0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp4f39Q8BGU0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp4f39Q8BGU0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp4f39Q8BGU0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp4f39Q8BGU0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp4f39Q8BGU0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp4f39Q8BGU0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp4f39Q8BGU0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cyp4f39Q8BGU0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cyp4f39Q8BGU0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cyp4f39Q8BGU0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cyp4f39Q8BGU0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cyp4f39Q8BGU0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyp4f39Q8BGU0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyp4f39Q8BGU0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyp4f39Q8BGU0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyp4f39Q8BGU0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyp4f39Q8BGU0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyp4f39Q8BGU0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyp4f39Q8BGU0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyp4f39Q8BGU0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyp4f39Q8BGU0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyp4f39Q8BGU0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyp4f39Q8BGU0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyp4f39Q8BGU0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyp4f39Q8BGU0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyp4f39Q8BGU0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyp4f39Q8BGU0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyp4f39Q8BGU0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyp4f39Q8BGU0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyp4f39Q8BGU0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyp4f39Q8BGU0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyp4f39Q8BGU0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyp4f39Q8BGU0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyp4f39Q8BGU0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyp4f39Q8BGU0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cyp4f39Q8BGU0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cyp4f39Q8BGU0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cyp4f39Q8BGU0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cyp4f39Q8BGU0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cyp4f39Q8BGU0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cyp4f39Q8BGU0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cyp4f39Q8BGU0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cyp4f39Q8BGU0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cyp4f39Q8BGU0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cyp4f39Q8BGU0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cyp4f39Q8BGU0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms