Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Srgap3Q812A2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Srgap3Q812A2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Srgap3Q812A2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Srgap3Q812A2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Srgap3Q812A2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Srgap3Q812A2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Srgap3Q812A2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Srgap3Q812A2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Srgap3Q812A2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Srgap3Q812A2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Srgap3Q812A2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Srgap3Q812A2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Srgap3Q812A2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Srgap3Q812A2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Srgap3Q812A2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Srgap3Q812A2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Srgap3Q812A2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Srgap3Q812A2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Srgap3Q812A2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Srgap3Q812A2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Srgap3Q812A2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Srgap3Q812A2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Srgap3Q812A2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Srgap3Q812A2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Srgap3Q812A2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Srgap3Q812A2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Srgap3Q812A2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Srgap3Q812A2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Srgap3Q812A2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Srgap3Q812A2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Srgap3Q812A2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Srgap3Q812A2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Srgap3Q812A2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Srgap3Q812A2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Srgap3Q812A2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Srgap3Q812A2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Srgap3Q812A2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Srgap3Q812A2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Srgap3Q812A2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Srgap3Q812A2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Srgap3Q812A2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Srgap3Q812A2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Srgap3Q812A2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Srgap3Q812A2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Srgap3Q812A2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Srgap3Q812A2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Srgap3Q812A2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Srgap3Q812A2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Srgap3Q812A2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Srgap3Q812A2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Srgap3Q812A2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Srgap3Q812A2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Srgap3Q812A2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Srgap3Q812A2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Srgap3Q812A2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Srgap3Q812A2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Srgap3Q812A2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Srgap3Q812A2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Srgap3Q812A2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Srgap3Q812A2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Srgap3Q812A2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Srgap3Q812A2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Srgap3Q812A2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Srgap3Q812A2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Srgap3Q812A2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Srgap3Q812A2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Srgap3Q812A2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Srgap3Q812A2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Srgap3Q812A2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Srgap3Q812A2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Srgap3Q812A2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Srgap3Q812A2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Srgap3Q812A2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Srgap3Q812A2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Srgap3Q812A2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Srgap3Q812A2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Srgap3Q812A2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Srgap3Q812A2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Srgap3Q812A2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Srgap3Q812A2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Srgap3Q812A2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Srgap3Q812A2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Srgap3Q812A2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Srgap3Q812A2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Srgap3Q812A2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Srgap3Q812A2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Srgap3Q812A2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Srgap3Q812A2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Srgap3Q812A2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Srgap3Q812A2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Srgap3Q812A2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Srgap3Q812A2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Srgap3Q812A2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Srgap3Q812A2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Srgap3Q812A2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Srgap3Q812A2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Srgap3Q812A2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Srgap3Q812A2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Srgap3Q812A2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms