Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SnupnQ80W37 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SnupnQ80W37 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SnupnQ80W37 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SnupnQ80W37 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SnupnQ80W37 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SnupnQ80W37 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SnupnQ80W37 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SnupnQ80W37 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SnupnQ80W37 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SnupnQ80W37 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SnupnQ80W37 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SnupnQ80W37 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SnupnQ80W37 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SnupnQ80W37 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SnupnQ80W37 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SnupnQ80W37 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SnupnQ80W37 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SnupnQ80W37 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SnupnQ80W37 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SnupnQ80W37 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SnupnQ80W37 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SnupnQ80W37 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SnupnQ80W37 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SnupnQ80W37 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SnupnQ80W37 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SnupnQ80W37 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SnupnQ80W37 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SnupnQ80W37 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SnupnQ80W37 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SnupnQ80W37 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SnupnQ80W37 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SnupnQ80W37 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SnupnQ80W37 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SnupnQ80W37 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SnupnQ80W37 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SnupnQ80W37 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SnupnQ80W37 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SnupnQ80W37 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SnupnQ80W37 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SnupnQ80W37 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SnupnQ80W37 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SnupnQ80W37 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SnupnQ80W37 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SnupnQ80W37 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SnupnQ80W37 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SnupnQ80W37 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SnupnQ80W37 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SnupnQ80W37 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SnupnQ80W37 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SnupnQ80W37 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SnupnQ80W37 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SnupnQ80W37 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SnupnQ80W37 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SnupnQ80W37 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SnupnQ80W37 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SnupnQ80W37 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SnupnQ80W37 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SnupnQ80W37 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SnupnQ80W37 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SnupnQ80W37 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SnupnQ80W37 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SnupnQ80W37 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SnupnQ80W37 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SnupnQ80W37 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SnupnQ80W37 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SnupnQ80W37 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SnupnQ80W37 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SnupnQ80W37 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SnupnQ80W37 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SnupnQ80W37 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SnupnQ80W37 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SnupnQ80W37 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SnupnQ80W37 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SnupnQ80W37 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SnupnQ80W37 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SnupnQ80W37 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SnupnQ80W37 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SnupnQ80W37 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SnupnQ80W37 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SnupnQ80W37 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SnupnQ80W37 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SnupnQ80W37 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SnupnQ80W37 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SnupnQ80W37 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SnupnQ80W37 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SnupnQ80W37 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SnupnQ80W37 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SnupnQ80W37 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SnupnQ80W37 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnupnQ80W37 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SnupnQ80W37 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnupnQ80W37 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnupnQ80W37 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SnupnQ80W37 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SnupnQ80W37 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SnupnQ80W37 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SnupnQ80W37 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SnupnQ80W37 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SnupnQ80W37 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms