Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc155Q80VJ8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc155Q80VJ8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc155Q80VJ8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc155Q80VJ8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc155Q80VJ8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccdc155Q80VJ8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc155Q80VJ8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc155Q80VJ8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc155Q80VJ8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc155Q80VJ8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc155Q80VJ8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc155Q80VJ8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc155Q80VJ8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc155Q80VJ8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc155Q80VJ8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc155Q80VJ8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc155Q80VJ8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc155Q80VJ8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc155Q80VJ8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc155Q80VJ8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc155Q80VJ8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc155Q80VJ8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc155Q80VJ8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc155Q80VJ8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc155Q80VJ8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc155Q80VJ8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc155Q80VJ8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc155Q80VJ8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc155Q80VJ8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc155Q80VJ8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc155Q80VJ8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc155Q80VJ8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc155Q80VJ8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc155Q80VJ8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc155Q80VJ8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc155Q80VJ8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc155Q80VJ8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc155Q80VJ8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc155Q80VJ8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc155Q80VJ8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc155Q80VJ8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc155Q80VJ8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc155Q80VJ8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc155Q80VJ8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc155Q80VJ8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc155Q80VJ8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc155Q80VJ8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc155Q80VJ8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc155Q80VJ8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc155Q80VJ8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc155Q80VJ8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc155Q80VJ8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc155Q80VJ8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc155Q80VJ8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc155Q80VJ8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc155Q80VJ8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc155Q80VJ8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc155Q80VJ8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc155Q80VJ8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc155Q80VJ8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc155Q80VJ8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc155Q80VJ8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc155Q80VJ8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc155Q80VJ8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc155Q80VJ8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc155Q80VJ8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc155Q80VJ8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc155Q80VJ8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc155Q80VJ8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc155Q80VJ8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc155Q80VJ8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc155Q80VJ8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc155Q80VJ8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc155Q80VJ8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc155Q80VJ8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc155Q80VJ8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc155Q80VJ8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc155Q80VJ8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc155Q80VJ8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc155Q80VJ8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc155Q80VJ8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc155Q80VJ8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc155Q80VJ8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc155Q80VJ8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc155Q80VJ8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc155Q80VJ8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc155Q80VJ8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc155Q80VJ8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc155Q80VJ8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc155Q80VJ8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc155Q80VJ8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc155Q80VJ8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc155Q80VJ8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc155Q80VJ8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc155Q80VJ8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc155Q80VJ8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc155Q80VJ8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc155Q80VJ8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc155Q80VJ8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms