Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ckap2lQ7TS74 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ckap2lQ7TS74 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ckap2lQ7TS74 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ckap2lQ7TS74 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ckap2lQ7TS74 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ckap2lQ7TS74 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ckap2lQ7TS74 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ckap2lQ7TS74 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ckap2lQ7TS74 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ckap2lQ7TS74 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ckap2lQ7TS74 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ckap2lQ7TS74 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ckap2lQ7TS74 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ckap2lQ7TS74 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ckap2lQ7TS74 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ckap2lQ7TS74 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ckap2lQ7TS74 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ckap2lQ7TS74 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ckap2lQ7TS74 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ckap2lQ7TS74 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ckap2lQ7TS74 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ckap2lQ7TS74 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ckap2lQ7TS74 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ckap2lQ7TS74 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ckap2lQ7TS74 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ckap2lQ7TS74 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ckap2lQ7TS74 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ckap2lQ7TS74 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ckap2lQ7TS74 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ckap2lQ7TS74 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ckap2lQ7TS74 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ckap2lQ7TS74 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ckap2lQ7TS74 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ckap2lQ7TS74 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ckap2lQ7TS74 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ckap2lQ7TS74 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ckap2lQ7TS74 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ckap2lQ7TS74 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ckap2lQ7TS74 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ckap2lQ7TS74 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ckap2lQ7TS74 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ckap2lQ7TS74 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ckap2lQ7TS74 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ckap2lQ7TS74 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ckap2lQ7TS74 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ckap2lQ7TS74 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ckap2lQ7TS74 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ckap2lQ7TS74 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ckap2lQ7TS74 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ckap2lQ7TS74 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ckap2lQ7TS74 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ckap2lQ7TS74 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ckap2lQ7TS74 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ckap2lQ7TS74 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ckap2lQ7TS74 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ckap2lQ7TS74 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ckap2lQ7TS74 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ckap2lQ7TS74 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ckap2lQ7TS74 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ckap2lQ7TS74 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ckap2lQ7TS74 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ckap2lQ7TS74 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ckap2lQ7TS74 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms