Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN58

Tmc8, Transmembrane channel-like protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc8Q7TN58 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmc8Q7TN58 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmc8Q7TN58 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmc8Q7TN58 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmc8Q7TN58 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmc8Q7TN58 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmc8Q7TN58 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmc8Q7TN58 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmc8Q7TN58 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmc8Q7TN58 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmc8Q7TN58 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmc8Q7TN58 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmc8Q7TN58 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmc8Q7TN58 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmc8Q7TN58 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmc8Q7TN58 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmc8Q7TN58 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmc8Q7TN58 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmc8Q7TN58 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmc8Q7TN58 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmc8Q7TN58 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmc8Q7TN58 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmc8Q7TN58 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmc8Q7TN58 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmc8Q7TN58 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmc8Q7TN58 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmc8Q7TN58 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmc8Q7TN58 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmc8Q7TN58 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmc8Q7TN58 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmc8Q7TN58 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmc8Q7TN58 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmc8Q7TN58 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmc8Q7TN58 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmc8Q7TN58 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmc8Q7TN58 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmc8Q7TN58 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmc8Q7TN58 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmc8Q7TN58 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmc8Q7TN58 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmc8Q7TN58 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmc8Q7TN58 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmc8Q7TN58 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmc8Q7TN58 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmc8Q7TN58 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmc8Q7TN58 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmc8Q7TN58 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmc8Q7TN58 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmc8Q7TN58 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmc8Q7TN58 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmc8Q7TN58 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmc8Q7TN58 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmc8Q7TN58 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmc8Q7TN58 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmc8Q7TN58 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmc8Q7TN58 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmc8Q7TN58 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmc8Q7TN58 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmc8Q7TN58 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmc8Q7TN58 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmc8Q7TN58 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmc8Q7TN58 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmc8Q7TN58 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmc8Q7TN58 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmc8Q7TN58 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmc8Q7TN58 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmc8Q7TN58 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmc8Q7TN58 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmc8Q7TN58 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmc8Q7TN58 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmc8Q7TN58 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmc8Q7TN58 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmc8Q7TN58 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmc8Q7TN58 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmc8Q7TN58 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmc8Q7TN58 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmc8Q7TN58 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmc8Q7TN58 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmc8Q7TN58 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmc8Q7TN58 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmc8Q7TN58 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmc8Q7TN58 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmc8Q7TN58 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmc8Q7TN58 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmc8Q7TN58 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmc8Q7TN58 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmc8Q7TN58 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmc8Q7TN58 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmc8Q7TN58 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmc8Q7TN58 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmc8Q7TN58 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmc8Q7TN58 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmc8Q7TN58 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmc8Q7TN58 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmc8Q7TN58 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmc8Q7TN58 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmc8Q7TN58 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmc8Q7TN58 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmc8Q7TN58 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmc8Q7TN58 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms