Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snd1Q78PY7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snd1Q78PY7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snd1Q78PY7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snd1Q78PY7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snd1Q78PY7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snd1Q78PY7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snd1Q78PY7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snd1Q78PY7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snd1Q78PY7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snd1Q78PY7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snd1Q78PY7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snd1Q78PY7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snd1Q78PY7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snd1Q78PY7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snd1Q78PY7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snd1Q78PY7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snd1Q78PY7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snd1Q78PY7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snd1Q78PY7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snd1Q78PY7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snd1Q78PY7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snd1Q78PY7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snd1Q78PY7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snd1Q78PY7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snd1Q78PY7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snd1Q78PY7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snd1Q78PY7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snd1Q78PY7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snd1Q78PY7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snd1Q78PY7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snd1Q78PY7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snd1Q78PY7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snd1Q78PY7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snd1Q78PY7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Snd1Q78PY7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snd1Q78PY7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snd1Q78PY7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snd1Q78PY7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snd1Q78PY7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snd1Q78PY7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snd1Q78PY7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snd1Q78PY7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snd1Q78PY7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snd1Q78PY7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snd1Q78PY7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snd1Q78PY7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snd1Q78PY7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snd1Q78PY7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snd1Q78PY7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snd1Q78PY7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snd1Q78PY7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snd1Q78PY7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snd1Q78PY7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snd1Q78PY7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snd1Q78PY7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snd1Q78PY7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snd1Q78PY7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snd1Q78PY7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snd1Q78PY7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Snd1Q78PY7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snd1Q78PY7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snd1Q78PY7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snd1Q78PY7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snd1Q78PY7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snd1Q78PY7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snd1Q78PY7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snd1Q78PY7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snd1Q78PY7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snd1Q78PY7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snd1Q78PY7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snd1Q78PY7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snd1Q78PY7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snd1Q78PY7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snd1Q78PY7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snd1Q78PY7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snd1Q78PY7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snd1Q78PY7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snd1Q78PY7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snd1Q78PY7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snd1Q78PY7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snd1Q78PY7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snd1Q78PY7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snd1Q78PY7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snd1Q78PY7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snd1Q78PY7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snd1Q78PY7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snd1Q78PY7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Snd1Q78PY7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Snd1Q78PY7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Snd1Q78PY7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snd1Q78PY7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snd1Q78PY7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snd1Q78PY7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snd1Q78PY7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snd1Q78PY7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snd1Q78PY7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snd1Q78PY7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snd1Q78PY7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snd1Q78PY7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms