Protein–RNA interactions for Protein: Q78KK3

Slc22a18, Solute carrier family 22 member 18, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a18Q78KK3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc22a18Q78KK3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc22a18Q78KK3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc22a18Q78KK3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc22a18Q78KK3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc22a18Q78KK3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc22a18Q78KK3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc22a18Q78KK3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc22a18Q78KK3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc22a18Q78KK3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc22a18Q78KK3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc22a18Q78KK3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc22a18Q78KK3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc22a18Q78KK3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc22a18Q78KK3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc22a18Q78KK3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc22a18Q78KK3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc22a18Q78KK3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc22a18Q78KK3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc22a18Q78KK3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc22a18Q78KK3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc22a18Q78KK3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc22a18Q78KK3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc22a18Q78KK3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc22a18Q78KK3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc22a18Q78KK3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc22a18Q78KK3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc22a18Q78KK3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc22a18Q78KK3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc22a18Q78KK3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc22a18Q78KK3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Slc22a18Q78KK3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc22a18Q78KK3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc22a18Q78KK3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc22a18Q78KK3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc22a18Q78KK3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc22a18Q78KK3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc22a18Q78KK3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc22a18Q78KK3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc22a18Q78KK3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc22a18Q78KK3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc22a18Q78KK3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc22a18Q78KK3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc22a18Q78KK3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc22a18Q78KK3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc22a18Q78KK3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc22a18Q78KK3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc22a18Q78KK3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc22a18Q78KK3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc22a18Q78KK3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc22a18Q78KK3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc22a18Q78KK3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc22a18Q78KK3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc22a18Q78KK3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc22a18Q78KK3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc22a18Q78KK3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc22a18Q78KK3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc22a18Q78KK3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc22a18Q78KK3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc22a18Q78KK3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc22a18Q78KK3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc22a18Q78KK3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc22a18Q78KK3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc22a18Q78KK3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc22a18Q78KK3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc22a18Q78KK3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc22a18Q78KK3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc22a18Q78KK3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc22a18Q78KK3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc22a18Q78KK3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc22a18Q78KK3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc22a18Q78KK3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc22a18Q78KK3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc22a18Q78KK3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc22a18Q78KK3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc22a18Q78KK3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc22a18Q78KK3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc22a18Q78KK3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc22a18Q78KK3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc22a18Q78KK3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Slc22a18Q78KK3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Slc22a18Q78KK3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Slc22a18Q78KK3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Slc22a18Q78KK3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Slc22a18Q78KK3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Slc22a18Q78KK3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Slc22a18Q78KK3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Slc22a18Q78KK3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc22a18Q78KK3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc22a18Q78KK3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc22a18Q78KK3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc22a18Q78KK3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc22a18Q78KK3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc22a18Q78KK3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc22a18Q78KK3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc22a18Q78KK3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc22a18Q78KK3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc22a18Q78KK3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc22a18Q78KK3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc22a18Q78KK3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms