Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed3Q78IS1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed3Q78IS1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed3Q78IS1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed3Q78IS1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed3Q78IS1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmed3Q78IS1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmed3Q78IS1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmed3Q78IS1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmed3Q78IS1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmed3Q78IS1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmed3Q78IS1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmed3Q78IS1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed3Q78IS1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed3Q78IS1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed3Q78IS1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed3Q78IS1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed3Q78IS1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed3Q78IS1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed3Q78IS1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed3Q78IS1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmed3Q78IS1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmed3Q78IS1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmed3Q78IS1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmed3Q78IS1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmed3Q78IS1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmed3Q78IS1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed3Q78IS1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed3Q78IS1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed3Q78IS1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed3Q78IS1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed3Q78IS1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmed3Q78IS1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmed3Q78IS1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmed3Q78IS1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmed3Q78IS1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmed3Q78IS1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmed3Q78IS1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmed3Q78IS1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmed3Q78IS1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmed3Q78IS1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmed3Q78IS1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmed3Q78IS1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmed3Q78IS1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmed3Q78IS1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmed3Q78IS1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmed3Q78IS1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmed3Q78IS1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmed3Q78IS1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmed3Q78IS1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmed3Q78IS1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed3Q78IS1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed3Q78IS1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed3Q78IS1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed3Q78IS1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmed3Q78IS1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmed3Q78IS1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmed3Q78IS1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmed3Q78IS1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmed3Q78IS1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmed3Q78IS1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmed3Q78IS1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmed3Q78IS1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmed3Q78IS1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed3Q78IS1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed3Q78IS1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed3Q78IS1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed3Q78IS1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed3Q78IS1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed3Q78IS1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed3Q78IS1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed3Q78IS1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed3Q78IS1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed3Q78IS1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed3Q78IS1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed3Q78IS1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed3Q78IS1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed3Q78IS1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed3Q78IS1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed3Q78IS1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed3Q78IS1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed3Q78IS1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed3Q78IS1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed3Q78IS1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmed3Q78IS1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmed3Q78IS1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmed3Q78IS1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmed3Q78IS1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 568.6 ms