Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWM4

Lsm8, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm8Q6ZWM4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lsm8Q6ZWM4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lsm8Q6ZWM4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lsm8Q6ZWM4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lsm8Q6ZWM4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lsm8Q6ZWM4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lsm8Q6ZWM4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lsm8Q6ZWM4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lsm8Q6ZWM4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lsm8Q6ZWM4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lsm8Q6ZWM4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lsm8Q6ZWM4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lsm8Q6ZWM4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lsm8Q6ZWM4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lsm8Q6ZWM4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lsm8Q6ZWM4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lsm8Q6ZWM4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lsm8Q6ZWM4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lsm8Q6ZWM4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lsm8Q6ZWM4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lsm8Q6ZWM4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lsm8Q6ZWM4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lsm8Q6ZWM4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lsm8Q6ZWM4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lsm8Q6ZWM4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lsm8Q6ZWM4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lsm8Q6ZWM4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lsm8Q6ZWM4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lsm8Q6ZWM4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lsm8Q6ZWM4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lsm8Q6ZWM4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lsm8Q6ZWM4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lsm8Q6ZWM4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lsm8Q6ZWM4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lsm8Q6ZWM4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lsm8Q6ZWM4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lsm8Q6ZWM4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lsm8Q6ZWM4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lsm8Q6ZWM4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lsm8Q6ZWM4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lsm8Q6ZWM4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lsm8Q6ZWM4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lsm8Q6ZWM4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lsm8Q6ZWM4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lsm8Q6ZWM4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lsm8Q6ZWM4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lsm8Q6ZWM4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms