Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gja6Q6S5G4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gja6Q6S5G4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gja6Q6S5G4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gja6Q6S5G4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gja6Q6S5G4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gja6Q6S5G4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gja6Q6S5G4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gja6Q6S5G4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gja6Q6S5G4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gja6Q6S5G4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gja6Q6S5G4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gja6Q6S5G4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gja6Q6S5G4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gja6Q6S5G4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gja6Q6S5G4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gja6Q6S5G4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gja6Q6S5G4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gja6Q6S5G4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gja6Q6S5G4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gja6Q6S5G4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gja6Q6S5G4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gja6Q6S5G4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gja6Q6S5G4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gja6Q6S5G4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gja6Q6S5G4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gja6Q6S5G4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gja6Q6S5G4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gja6Q6S5G4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gja6Q6S5G4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gja6Q6S5G4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gja6Q6S5G4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gja6Q6S5G4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gja6Q6S5G4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gja6Q6S5G4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gja6Q6S5G4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gja6Q6S5G4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gja6Q6S5G4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gja6Q6S5G4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gja6Q6S5G4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gja6Q6S5G4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gja6Q6S5G4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gja6Q6S5G4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gja6Q6S5G4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gja6Q6S5G4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gja6Q6S5G4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gja6Q6S5G4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gja6Q6S5G4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gja6Q6S5G4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gja6Q6S5G4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gja6Q6S5G4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gja6Q6S5G4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gja6Q6S5G4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gja6Q6S5G4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gja6Q6S5G4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gja6Q6S5G4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gja6Q6S5G4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gja6Q6S5G4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gja6Q6S5G4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gja6Q6S5G4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gja6Q6S5G4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gja6Q6S5G4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gja6Q6S5G4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gja6Q6S5G4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gja6Q6S5G4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gja6Q6S5G4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gja6Q6S5G4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gja6Q6S5G4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gja6Q6S5G4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gja6Q6S5G4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gja6Q6S5G4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gja6Q6S5G4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gja6Q6S5G4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gja6Q6S5G4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gja6Q6S5G4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gja6Q6S5G4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gja6Q6S5G4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gja6Q6S5G4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gja6Q6S5G4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gja6Q6S5G4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gja6Q6S5G4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gja6Q6S5G4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gja6Q6S5G4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gja6Q6S5G4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gja6Q6S5G4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gja6Q6S5G4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gja6Q6S5G4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gja6Q6S5G4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gja6Q6S5G4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gja6Q6S5G4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gja6Q6S5G4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gja6Q6S5G4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gja6Q6S5G4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gja6Q6S5G4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gja6Q6S5G4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gja6Q6S5G4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gja6Q6S5G4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gja6Q6S5G4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gja6Q6S5G4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gja6Q6S5G4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms