Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIU9

Uncharacterized protein FLJ45252 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PIU9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6PIU9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6PIU9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6PIU9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6PIU9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q6PIU9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q6PIU9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q6PIU9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q6PIU9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q6PIU9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Q6PIU9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q6PIU9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q6PIU9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q6PIU9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6PIU9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6PIU9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6PIU9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6PIU9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6PIU9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6PIU9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q6PIU9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q6PIU9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q6PIU9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q6PIU9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q6PIU9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q6PIU9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q6PIU9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Q6PIU9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q6PIU9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q6PIU9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q6PIU9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q6PIU9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q6PIU9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q6PIU9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q6PIU9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q6PIU9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q6PIU9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q6PIU9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q6PIU9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q6PIU9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q6PIU9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q6PIU9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q6PIU9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Q6PIU9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms