Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGG2

Gmip, GEM-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GmipQ6PGG2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GmipQ6PGG2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GmipQ6PGG2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GmipQ6PGG2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GmipQ6PGG2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GmipQ6PGG2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GmipQ6PGG2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GmipQ6PGG2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GmipQ6PGG2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GmipQ6PGG2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GmipQ6PGG2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GmipQ6PGG2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GmipQ6PGG2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GmipQ6PGG2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GmipQ6PGG2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GmipQ6PGG2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GmipQ6PGG2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GmipQ6PGG2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GmipQ6PGG2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GmipQ6PGG2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GmipQ6PGG2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GmipQ6PGG2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GmipQ6PGG2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GmipQ6PGG2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GmipQ6PGG2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GmipQ6PGG2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GmipQ6PGG2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GmipQ6PGG2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GmipQ6PGG2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GmipQ6PGG2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GmipQ6PGG2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GmipQ6PGG2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GmipQ6PGG2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GmipQ6PGG2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GmipQ6PGG2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GmipQ6PGG2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GmipQ6PGG2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GmipQ6PGG2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GmipQ6PGG2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GmipQ6PGG2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GmipQ6PGG2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GmipQ6PGG2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GmipQ6PGG2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GmipQ6PGG2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GmipQ6PGG2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GmipQ6PGG2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GmipQ6PGG2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GmipQ6PGG2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GmipQ6PGG2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GmipQ6PGG2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GmipQ6PGG2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GmipQ6PGG2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GmipQ6PGG2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GmipQ6PGG2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GmipQ6PGG2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GmipQ6PGG2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GmipQ6PGG2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GmipQ6PGG2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GmipQ6PGG2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GmipQ6PGG2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GmipQ6PGG2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GmipQ6PGG2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
GmipQ6PGG2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GmipQ6PGG2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GmipQ6PGG2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GmipQ6PGG2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GmipQ6PGG2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GmipQ6PGG2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GmipQ6PGG2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GmipQ6PGG2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GmipQ6PGG2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GmipQ6PGG2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GmipQ6PGG2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GmipQ6PGG2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GmipQ6PGG2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GmipQ6PGG2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GmipQ6PGG2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GmipQ6PGG2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GmipQ6PGG2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GmipQ6PGG2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GmipQ6PGG2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GmipQ6PGG2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GmipQ6PGG2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GmipQ6PGG2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GmipQ6PGG2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GmipQ6PGG2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GmipQ6PGG2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GmipQ6PGG2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GmipQ6PGG2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GmipQ6PGG2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GmipQ6PGG2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GmipQ6PGG2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GmipQ6PGG2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GmipQ6PGG2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GmipQ6PGG2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GmipQ6PGG2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GmipQ6PGG2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GmipQ6PGG2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GmipQ6PGG2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GmipQ6PGG2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms