Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM1

Msl1, Male-specific lethal 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl1Q6PDM1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Msl1Q6PDM1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Msl1Q6PDM1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Msl1Q6PDM1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Msl1Q6PDM1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Msl1Q6PDM1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Msl1Q6PDM1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Msl1Q6PDM1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Msl1Q6PDM1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Msl1Q6PDM1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Msl1Q6PDM1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Msl1Q6PDM1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Msl1Q6PDM1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Msl1Q6PDM1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Msl1Q6PDM1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Msl1Q6PDM1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Msl1Q6PDM1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Msl1Q6PDM1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Msl1Q6PDM1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Msl1Q6PDM1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Msl1Q6PDM1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Msl1Q6PDM1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Msl1Q6PDM1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Msl1Q6PDM1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Msl1Q6PDM1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Msl1Q6PDM1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Msl1Q6PDM1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Msl1Q6PDM1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Msl1Q6PDM1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Msl1Q6PDM1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Msl1Q6PDM1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Msl1Q6PDM1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Msl1Q6PDM1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Msl1Q6PDM1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Msl1Q6PDM1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Msl1Q6PDM1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Msl1Q6PDM1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Msl1Q6PDM1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Msl1Q6PDM1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Msl1Q6PDM1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Msl1Q6PDM1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Msl1Q6PDM1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Msl1Q6PDM1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Msl1Q6PDM1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Msl1Q6PDM1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Msl1Q6PDM1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Msl1Q6PDM1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Msl1Q6PDM1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Msl1Q6PDM1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Msl1Q6PDM1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Msl1Q6PDM1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Msl1Q6PDM1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Msl1Q6PDM1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Msl1Q6PDM1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Msl1Q6PDM1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Msl1Q6PDM1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Msl1Q6PDM1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Msl1Q6PDM1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Msl1Q6PDM1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Msl1Q6PDM1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Msl1Q6PDM1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Msl1Q6PDM1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Msl1Q6PDM1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Msl1Q6PDM1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Msl1Q6PDM1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Msl1Q6PDM1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Msl1Q6PDM1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Msl1Q6PDM1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Msl1Q6PDM1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Msl1Q6PDM1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Msl1Q6PDM1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Msl1Q6PDM1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Msl1Q6PDM1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Msl1Q6PDM1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Msl1Q6PDM1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Msl1Q6PDM1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Msl1Q6PDM1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Msl1Q6PDM1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Msl1Q6PDM1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Msl1Q6PDM1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Msl1Q6PDM1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Msl1Q6PDM1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Msl1Q6PDM1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Msl1Q6PDM1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Msl1Q6PDM1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Msl1Q6PDM1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Msl1Q6PDM1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Msl1Q6PDM1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Msl1Q6PDM1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Msl1Q6PDM1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Msl1Q6PDM1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Msl1Q6PDM1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Msl1Q6PDM1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Msl1Q6PDM1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Msl1Q6PDM1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Msl1Q6PDM1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Msl1Q6PDM1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Msl1Q6PDM1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Msl1Q6PDM1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Msl1Q6PDM1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms