Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mfsd13aQ6PDE8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mfsd13aQ6PDE8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mfsd13aQ6PDE8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mfsd13aQ6PDE8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mfsd13aQ6PDE8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mfsd13aQ6PDE8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mfsd13aQ6PDE8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mfsd13aQ6PDE8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mfsd13aQ6PDE8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mfsd13aQ6PDE8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mfsd13aQ6PDE8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Mfsd13aQ6PDE8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mfsd13aQ6PDE8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mfsd13aQ6PDE8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mfsd13aQ6PDE8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mfsd13aQ6PDE8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mfsd13aQ6PDE8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mfsd13aQ6PDE8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mfsd13aQ6PDE8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mfsd13aQ6PDE8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mfsd13aQ6PDE8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mfsd13aQ6PDE8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mfsd13aQ6PDE8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mfsd13aQ6PDE8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mfsd13aQ6PDE8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mfsd13aQ6PDE8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mfsd13aQ6PDE8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mfsd13aQ6PDE8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Mfsd13aQ6PDE8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mfsd13aQ6PDE8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mfsd13aQ6PDE8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mfsd13aQ6PDE8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mfsd13aQ6PDE8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mfsd13aQ6PDE8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mfsd13aQ6PDE8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mfsd13aQ6PDE8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mfsd13aQ6PDE8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Mfsd13aQ6PDE8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mfsd13aQ6PDE8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mfsd13aQ6PDE8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mfsd13aQ6PDE8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mfsd13aQ6PDE8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mfsd13aQ6PDE8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mfsd13aQ6PDE8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mfsd13aQ6PDE8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mfsd13aQ6PDE8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mfsd13aQ6PDE8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mfsd13aQ6PDE8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Mfsd13aQ6PDE8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mfsd13aQ6PDE8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mfsd13aQ6PDE8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mfsd13aQ6PDE8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mfsd13aQ6PDE8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mfsd13aQ6PDE8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mfsd13aQ6PDE8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mfsd13aQ6PDE8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mfsd13aQ6PDE8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mfsd13aQ6PDE8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mfsd13aQ6PDE8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mfsd13aQ6PDE8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mfsd13aQ6PDE8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mfsd13aQ6PDE8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Mfsd13aQ6PDE8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mfsd13aQ6PDE8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Mfsd13aQ6PDE8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mfsd13aQ6PDE8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mfsd13aQ6PDE8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mfsd13aQ6PDE8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mfsd13aQ6PDE8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mfsd13aQ6PDE8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mfsd13aQ6PDE8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mfsd13aQ6PDE8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mfsd13aQ6PDE8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mfsd13aQ6PDE8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mfsd13aQ6PDE8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mfsd13aQ6PDE8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mfsd13aQ6PDE8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mfsd13aQ6PDE8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Mfsd13aQ6PDE8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mfsd13aQ6PDE8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mfsd13aQ6PDE8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mfsd13aQ6PDE8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mfsd13aQ6PDE8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Mfsd13aQ6PDE8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mfsd13aQ6PDE8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mfsd13aQ6PDE8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mfsd13aQ6PDE8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mfsd13aQ6PDE8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mfsd13aQ6PDE8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mfsd13aQ6PDE8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mfsd13aQ6PDE8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mfsd13aQ6PDE8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.3 ms