Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyp2d40Q6P8N9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyp2d40Q6P8N9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyp2d40Q6P8N9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyp2d40Q6P8N9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyp2d40Q6P8N9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyp2d40Q6P8N9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyp2d40Q6P8N9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyp2d40Q6P8N9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyp2d40Q6P8N9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp2d40Q6P8N9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp2d40Q6P8N9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp2d40Q6P8N9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp2d40Q6P8N9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp2d40Q6P8N9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp2d40Q6P8N9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp2d40Q6P8N9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp2d40Q6P8N9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp2d40Q6P8N9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp2d40Q6P8N9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp2d40Q6P8N9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp2d40Q6P8N9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp2d40Q6P8N9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp2d40Q6P8N9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp2d40Q6P8N9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp2d40Q6P8N9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp2d40Q6P8N9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp2d40Q6P8N9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyp2d40Q6P8N9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyp2d40Q6P8N9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyp2d40Q6P8N9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyp2d40Q6P8N9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyp2d40Q6P8N9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyp2d40Q6P8N9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyp2d40Q6P8N9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cyp2d40Q6P8N9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cyp2d40Q6P8N9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cyp2d40Q6P8N9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cyp2d40Q6P8N9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cyp2d40Q6P8N9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cyp2d40Q6P8N9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyp2d40Q6P8N9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyp2d40Q6P8N9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyp2d40Q6P8N9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyp2d40Q6P8N9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyp2d40Q6P8N9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyp2d40Q6P8N9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyp2d40Q6P8N9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyp2d40Q6P8N9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyp2d40Q6P8N9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyp2d40Q6P8N9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyp2d40Q6P8N9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyp2d40Q6P8N9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyp2d40Q6P8N9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyp2d40Q6P8N9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyp2d40Q6P8N9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyp2d40Q6P8N9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyp2d40Q6P8N9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cyp2d40Q6P8N9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cyp2d40Q6P8N9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cyp2d40Q6P8N9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cyp2d40Q6P8N9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cyp2d40Q6P8N9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cyp2d40Q6P8N9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp2d40Q6P8N9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp2d40Q6P8N9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp2d40Q6P8N9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp2d40Q6P8N9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp2d40Q6P8N9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp2d40Q6P8N9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp2d40Q6P8N9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cyp2d40Q6P8N9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cyp2d40Q6P8N9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cyp2d40Q6P8N9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cyp2d40Q6P8N9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cyp2d40Q6P8N9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cyp2d40Q6P8N9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cyp2d40Q6P8N9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cyp2d40Q6P8N9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cyp2d40Q6P8N9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cyp2d40Q6P8N9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cyp2d40Q6P8N9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cyp2d40Q6P8N9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cyp2d40Q6P8N9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cyp2d40Q6P8N9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cyp2d40Q6P8N9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp2d40Q6P8N9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp2d40Q6P8N9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp2d40Q6P8N9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp2d40Q6P8N9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp2d40Q6P8N9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp2d40Q6P8N9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp2d40Q6P8N9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp2d40Q6P8N9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp2d40Q6P8N9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp2d40Q6P8N9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms