Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVG7

Colgalt2, Procollagen galactosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt2Q6NVG7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Colgalt2Q6NVG7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Colgalt2Q6NVG7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Colgalt2Q6NVG7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Colgalt2Q6NVG7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Colgalt2Q6NVG7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Colgalt2Q6NVG7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Colgalt2Q6NVG7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Colgalt2Q6NVG7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Colgalt2Q6NVG7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Colgalt2Q6NVG7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Colgalt2Q6NVG7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Colgalt2Q6NVG7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Colgalt2Q6NVG7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Colgalt2Q6NVG7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Colgalt2Q6NVG7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Colgalt2Q6NVG7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Colgalt2Q6NVG7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Colgalt2Q6NVG7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Colgalt2Q6NVG7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Colgalt2Q6NVG7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Colgalt2Q6NVG7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Colgalt2Q6NVG7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Colgalt2Q6NVG7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Colgalt2Q6NVG7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Colgalt2Q6NVG7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Colgalt2Q6NVG7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Colgalt2Q6NVG7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Colgalt2Q6NVG7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Colgalt2Q6NVG7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Colgalt2Q6NVG7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Colgalt2Q6NVG7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Colgalt2Q6NVG7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Colgalt2Q6NVG7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Colgalt2Q6NVG7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Colgalt2Q6NVG7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Colgalt2Q6NVG7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Colgalt2Q6NVG7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Colgalt2Q6NVG7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Colgalt2Q6NVG7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Colgalt2Q6NVG7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Colgalt2Q6NVG7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Colgalt2Q6NVG7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Colgalt2Q6NVG7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Colgalt2Q6NVG7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Colgalt2Q6NVG7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Colgalt2Q6NVG7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Colgalt2Q6NVG7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Colgalt2Q6NVG7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Colgalt2Q6NVG7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Colgalt2Q6NVG7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Colgalt2Q6NVG7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Colgalt2Q6NVG7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Colgalt2Q6NVG7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Colgalt2Q6NVG7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Colgalt2Q6NVG7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Colgalt2Q6NVG7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Colgalt2Q6NVG7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Colgalt2Q6NVG7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Colgalt2Q6NVG7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Colgalt2Q6NVG7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Colgalt2Q6NVG7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Colgalt2Q6NVG7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Colgalt2Q6NVG7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Colgalt2Q6NVG7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Colgalt2Q6NVG7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Colgalt2Q6NVG7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Colgalt2Q6NVG7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Colgalt2Q6NVG7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Colgalt2Q6NVG7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Colgalt2Q6NVG7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Colgalt2Q6NVG7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Colgalt2Q6NVG7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Colgalt2Q6NVG7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Colgalt2Q6NVG7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Colgalt2Q6NVG7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Colgalt2Q6NVG7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Colgalt2Q6NVG7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Colgalt2Q6NVG7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Colgalt2Q6NVG7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Colgalt2Q6NVG7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Colgalt2Q6NVG7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Colgalt2Q6NVG7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Colgalt2Q6NVG7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Colgalt2Q6NVG7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Colgalt2Q6NVG7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Colgalt2Q6NVG7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Colgalt2Q6NVG7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Colgalt2Q6NVG7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Colgalt2Q6NVG7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Colgalt2Q6NVG7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Colgalt2Q6NVG7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Colgalt2Q6NVG7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Colgalt2Q6NVG7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Colgalt2Q6NVG7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Colgalt2Q6NVG7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Colgalt2Q6NVG7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Colgalt2Q6NVG7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Colgalt2Q6NVG7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Colgalt2Q6NVG7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms