Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD9

Bfsp2, Phakinin, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bfsp2Q6NVD9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bfsp2Q6NVD9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bfsp2Q6NVD9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bfsp2Q6NVD9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Bfsp2Q6NVD9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Bfsp2Q6NVD9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Bfsp2Q6NVD9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Bfsp2Q6NVD9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bfsp2Q6NVD9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bfsp2Q6NVD9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bfsp2Q6NVD9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bfsp2Q6NVD9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bfsp2Q6NVD9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bfsp2Q6NVD9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bfsp2Q6NVD9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bfsp2Q6NVD9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bfsp2Q6NVD9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bfsp2Q6NVD9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bfsp2Q6NVD9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bfsp2Q6NVD9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bfsp2Q6NVD9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bfsp2Q6NVD9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bfsp2Q6NVD9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bfsp2Q6NVD9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bfsp2Q6NVD9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bfsp2Q6NVD9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bfsp2Q6NVD9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Bfsp2Q6NVD9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bfsp2Q6NVD9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bfsp2Q6NVD9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bfsp2Q6NVD9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bfsp2Q6NVD9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bfsp2Q6NVD9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bfsp2Q6NVD9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bfsp2Q6NVD9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bfsp2Q6NVD9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bfsp2Q6NVD9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Bfsp2Q6NVD9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bfsp2Q6NVD9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bfsp2Q6NVD9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bfsp2Q6NVD9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bfsp2Q6NVD9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bfsp2Q6NVD9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bfsp2Q6NVD9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bfsp2Q6NVD9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bfsp2Q6NVD9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bfsp2Q6NVD9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Bfsp2Q6NVD9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Bfsp2Q6NVD9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bfsp2Q6NVD9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bfsp2Q6NVD9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bfsp2Q6NVD9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bfsp2Q6NVD9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bfsp2Q6NVD9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bfsp2Q6NVD9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bfsp2Q6NVD9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bfsp2Q6NVD9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bfsp2Q6NVD9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bfsp2Q6NVD9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bfsp2Q6NVD9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bfsp2Q6NVD9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bfsp2Q6NVD9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bfsp2Q6NVD9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bfsp2Q6NVD9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bfsp2Q6NVD9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bfsp2Q6NVD9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bfsp2Q6NVD9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Bfsp2Q6NVD9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bfsp2Q6NVD9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Bfsp2Q6NVD9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bfsp2Q6NVD9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bfsp2Q6NVD9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bfsp2Q6NVD9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bfsp2Q6NVD9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bfsp2Q6NVD9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bfsp2Q6NVD9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bfsp2Q6NVD9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bfsp2Q6NVD9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bfsp2Q6NVD9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bfsp2Q6NVD9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bfsp2Q6NVD9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bfsp2Q6NVD9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bfsp2Q6NVD9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bfsp2Q6NVD9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bfsp2Q6NVD9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bfsp2Q6NVD9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bfsp2Q6NVD9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bfsp2Q6NVD9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bfsp2Q6NVD9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bfsp2Q6NVD9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bfsp2Q6NVD9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Bfsp2Q6NVD9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bfsp2Q6NVD9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Bfsp2Q6NVD9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Bfsp2Q6NVD9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bfsp2Q6NVD9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bfsp2Q6NVD9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bfsp2Q6NVD9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bfsp2Q6NVD9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bfsp2Q6NVD9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms