Protein–RNA interactions for Protein: Q6K1E7

Ggnbp1, Gametogenetin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp1Q6K1E7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ggnbp1Q6K1E7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ggnbp1Q6K1E7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ggnbp1Q6K1E7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ggnbp1Q6K1E7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ggnbp1Q6K1E7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ggnbp1Q6K1E7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ggnbp1Q6K1E7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ggnbp1Q6K1E7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ggnbp1Q6K1E7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ggnbp1Q6K1E7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ggnbp1Q6K1E7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ggnbp1Q6K1E7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ggnbp1Q6K1E7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ggnbp1Q6K1E7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ggnbp1Q6K1E7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ggnbp1Q6K1E7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ggnbp1Q6K1E7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ggnbp1Q6K1E7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ggnbp1Q6K1E7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ggnbp1Q6K1E7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ggnbp1Q6K1E7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ggnbp1Q6K1E7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ggnbp1Q6K1E7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ggnbp1Q6K1E7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ggnbp1Q6K1E7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ggnbp1Q6K1E7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ggnbp1Q6K1E7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ggnbp1Q6K1E7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ggnbp1Q6K1E7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ggnbp1Q6K1E7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ggnbp1Q6K1E7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ggnbp1Q6K1E7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ggnbp1Q6K1E7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ggnbp1Q6K1E7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ggnbp1Q6K1E7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ggnbp1Q6K1E7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ggnbp1Q6K1E7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ggnbp1Q6K1E7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ggnbp1Q6K1E7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ggnbp1Q6K1E7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ggnbp1Q6K1E7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ggnbp1Q6K1E7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ggnbp1Q6K1E7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ggnbp1Q6K1E7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ggnbp1Q6K1E7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ggnbp1Q6K1E7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ggnbp1Q6K1E7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ggnbp1Q6K1E7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ggnbp1Q6K1E7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ggnbp1Q6K1E7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ggnbp1Q6K1E7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ggnbp1Q6K1E7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ggnbp1Q6K1E7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ggnbp1Q6K1E7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ggnbp1Q6K1E7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ggnbp1Q6K1E7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ggnbp1Q6K1E7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ggnbp1Q6K1E7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ggnbp1Q6K1E7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ggnbp1Q6K1E7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ggnbp1Q6K1E7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ggnbp1Q6K1E7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ggnbp1Q6K1E7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ggnbp1Q6K1E7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ggnbp1Q6K1E7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ggnbp1Q6K1E7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ggnbp1Q6K1E7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ggnbp1Q6K1E7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ggnbp1Q6K1E7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ggnbp1Q6K1E7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ggnbp1Q6K1E7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ggnbp1Q6K1E7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ggnbp1Q6K1E7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ggnbp1Q6K1E7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ggnbp1Q6K1E7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ggnbp1Q6K1E7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ggnbp1Q6K1E7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ggnbp1Q6K1E7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ggnbp1Q6K1E7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ggnbp1Q6K1E7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ggnbp1Q6K1E7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ggnbp1Q6K1E7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ggnbp1Q6K1E7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ggnbp1Q6K1E7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ggnbp1Q6K1E7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ggnbp1Q6K1E7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ggnbp1Q6K1E7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ggnbp1Q6K1E7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ggnbp1Q6K1E7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ggnbp1Q6K1E7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ggnbp1Q6K1E7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ggnbp1Q6K1E7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ggnbp1Q6K1E7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ggnbp1Q6K1E7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ggnbp1Q6K1E7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ggnbp1Q6K1E7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms