Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMF0

Krt87, Keratin, type II cuticular 87, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt87Q6IMF0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt87Q6IMF0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt87Q6IMF0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt87Q6IMF0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt87Q6IMF0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt87Q6IMF0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt87Q6IMF0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt87Q6IMF0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt87Q6IMF0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt87Q6IMF0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt87Q6IMF0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt87Q6IMF0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt87Q6IMF0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt87Q6IMF0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt87Q6IMF0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt87Q6IMF0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt87Q6IMF0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt87Q6IMF0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt87Q6IMF0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt87Q6IMF0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt87Q6IMF0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt87Q6IMF0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt87Q6IMF0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt87Q6IMF0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt87Q6IMF0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt87Q6IMF0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Krt87Q6IMF0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt87Q6IMF0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt87Q6IMF0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt87Q6IMF0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt87Q6IMF0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt87Q6IMF0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt87Q6IMF0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt87Q6IMF0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt87Q6IMF0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt87Q6IMF0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt87Q6IMF0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt87Q6IMF0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Krt87Q6IMF0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Krt87Q6IMF0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Krt87Q6IMF0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Krt87Q6IMF0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt87Q6IMF0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt87Q6IMF0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt87Q6IMF0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt87Q6IMF0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt87Q6IMF0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt87Q6IMF0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt87Q6IMF0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt87Q6IMF0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt87Q6IMF0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt87Q6IMF0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt87Q6IMF0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt87Q6IMF0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt87Q6IMF0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt87Q6IMF0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt87Q6IMF0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt87Q6IMF0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt87Q6IMF0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt87Q6IMF0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt87Q6IMF0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt87Q6IMF0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt87Q6IMF0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt87Q6IMF0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt87Q6IMF0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt87Q6IMF0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt87Q6IMF0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt87Q6IMF0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt87Q6IMF0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt87Q6IMF0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt87Q6IMF0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt87Q6IMF0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt87Q6IMF0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt87Q6IMF0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Krt87Q6IMF0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Krt87Q6IMF0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt87Q6IMF0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt87Q6IMF0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt87Q6IMF0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt87Q6IMF0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt87Q6IMF0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt87Q6IMF0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt87Q6IMF0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt87Q6IMF0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt87Q6IMF0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt87Q6IMF0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt87Q6IMF0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt87Q6IMF0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt87Q6IMF0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt87Q6IMF0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt87Q6IMF0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt87Q6IMF0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt87Q6IMF0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt87Q6IMF0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt87Q6IMF0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt87Q6IMF0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt87Q6IMF0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt87Q6IMF0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt87Q6IMF0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt87Q6IMF0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms