Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQT9

Nomo1, Nodal modulator 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nomo1Q6GQT9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nomo1Q6GQT9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nomo1Q6GQT9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nomo1Q6GQT9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nomo1Q6GQT9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nomo1Q6GQT9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nomo1Q6GQT9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nomo1Q6GQT9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nomo1Q6GQT9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nomo1Q6GQT9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nomo1Q6GQT9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nomo1Q6GQT9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nomo1Q6GQT9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nomo1Q6GQT9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nomo1Q6GQT9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nomo1Q6GQT9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nomo1Q6GQT9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nomo1Q6GQT9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nomo1Q6GQT9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nomo1Q6GQT9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nomo1Q6GQT9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nomo1Q6GQT9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nomo1Q6GQT9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nomo1Q6GQT9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nomo1Q6GQT9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nomo1Q6GQT9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nomo1Q6GQT9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nomo1Q6GQT9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nomo1Q6GQT9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nomo1Q6GQT9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nomo1Q6GQT9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nomo1Q6GQT9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nomo1Q6GQT9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nomo1Q6GQT9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nomo1Q6GQT9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nomo1Q6GQT9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nomo1Q6GQT9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nomo1Q6GQT9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nomo1Q6GQT9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nomo1Q6GQT9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nomo1Q6GQT9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nomo1Q6GQT9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nomo1Q6GQT9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nomo1Q6GQT9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nomo1Q6GQT9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nomo1Q6GQT9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nomo1Q6GQT9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nomo1Q6GQT9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nomo1Q6GQT9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nomo1Q6GQT9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nomo1Q6GQT9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nomo1Q6GQT9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nomo1Q6GQT9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nomo1Q6GQT9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nomo1Q6GQT9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nomo1Q6GQT9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nomo1Q6GQT9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nomo1Q6GQT9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nomo1Q6GQT9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nomo1Q6GQT9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nomo1Q6GQT9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nomo1Q6GQT9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nomo1Q6GQT9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nomo1Q6GQT9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nomo1Q6GQT9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nomo1Q6GQT9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nomo1Q6GQT9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nomo1Q6GQT9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nomo1Q6GQT9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nomo1Q6GQT9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nomo1Q6GQT9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nomo1Q6GQT9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nomo1Q6GQT9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nomo1Q6GQT9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nomo1Q6GQT9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nomo1Q6GQT9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nomo1Q6GQT9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nomo1Q6GQT9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nomo1Q6GQT9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nomo1Q6GQT9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nomo1Q6GQT9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nomo1Q6GQT9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nomo1Q6GQT9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nomo1Q6GQT9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nomo1Q6GQT9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nomo1Q6GQT9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nomo1Q6GQT9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nomo1Q6GQT9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nomo1Q6GQT9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nomo1Q6GQT9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nomo1Q6GQT9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nomo1Q6GQT9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nomo1Q6GQT9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nomo1Q6GQT9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nomo1Q6GQT9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nomo1Q6GQT9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nomo1Q6GQT9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nomo1Q6GQT9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nomo1Q6GQT9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nomo1Q6GQT9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms