Protein–RNA interactions for Protein: Q6A026

Pds5a, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pds5aQ6A026 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pds5aQ6A026 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pds5aQ6A026 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pds5aQ6A026 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pds5aQ6A026 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pds5aQ6A026 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pds5aQ6A026 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pds5aQ6A026 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pds5aQ6A026 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pds5aQ6A026 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pds5aQ6A026 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pds5aQ6A026 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pds5aQ6A026 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pds5aQ6A026 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pds5aQ6A026 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pds5aQ6A026 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pds5aQ6A026 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Pds5aQ6A026 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Pds5aQ6A026 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pds5aQ6A026 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pds5aQ6A026 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pds5aQ6A026 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pds5aQ6A026 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pds5aQ6A026 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pds5aQ6A026 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pds5aQ6A026 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pds5aQ6A026 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pds5aQ6A026 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pds5aQ6A026 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pds5aQ6A026 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pds5aQ6A026 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pds5aQ6A026 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pds5aQ6A026 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pds5aQ6A026 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pds5aQ6A026 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pds5aQ6A026 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pds5aQ6A026 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pds5aQ6A026 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pds5aQ6A026 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pds5aQ6A026 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pds5aQ6A026 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pds5aQ6A026 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pds5aQ6A026 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pds5aQ6A026 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pds5aQ6A026 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pds5aQ6A026 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pds5aQ6A026 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pds5aQ6A026 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pds5aQ6A026 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pds5aQ6A026 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pds5aQ6A026 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pds5aQ6A026 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pds5aQ6A026 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pds5aQ6A026 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pds5aQ6A026 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pds5aQ6A026 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pds5aQ6A026 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pds5aQ6A026 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pds5aQ6A026 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pds5aQ6A026 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pds5aQ6A026 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pds5aQ6A026 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pds5aQ6A026 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pds5aQ6A026 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pds5aQ6A026 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pds5aQ6A026 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pds5aQ6A026 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pds5aQ6A026 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pds5aQ6A026 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pds5aQ6A026 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pds5aQ6A026 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pds5aQ6A026 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Pds5aQ6A026 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pds5aQ6A026 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pds5aQ6A026 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pds5aQ6A026 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pds5aQ6A026 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pds5aQ6A026 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pds5aQ6A026 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pds5aQ6A026 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pds5aQ6A026 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pds5aQ6A026 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pds5aQ6A026 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pds5aQ6A026 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pds5aQ6A026 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pds5aQ6A026 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pds5aQ6A026 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pds5aQ6A026 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pds5aQ6A026 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pds5aQ6A026 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pds5aQ6A026 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pds5aQ6A026 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pds5aQ6A026 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pds5aQ6A026 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pds5aQ6A026 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Pds5aQ6A026 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Pds5aQ6A026 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pds5aQ6A026 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pds5aQ6A026 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pds5aQ6A026 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms