Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Cdk13Q69ZA1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Cdk13Q69ZA1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Cdk13Q69ZA1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Cdk13Q69ZA1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Cdk13Q69ZA1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Cdk13Q69ZA1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Cdk13Q69ZA1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Cdk13Q69ZA1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Cdk13Q69ZA1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Cdk13Q69ZA1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Cdk13Q69ZA1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Cdk13Q69ZA1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Cdk13Q69ZA1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Cdk13Q69ZA1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Cdk13Q69ZA1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Cdk13Q69ZA1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Cdk13Q69ZA1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Cdk13Q69ZA1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Cdk13Q69ZA1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Cdk13Q69ZA1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Cdk13Q69ZA1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Cdk13Q69ZA1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Cdk13Q69ZA1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Cdk13Q69ZA1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Cdk13Q69ZA1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Cdk13Q69ZA1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Cdk13Q69ZA1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Cdk13Q69ZA1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Cdk13Q69ZA1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Cdk13Q69ZA1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Cdk13Q69ZA1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Cdk13Q69ZA1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Cdk13Q69ZA1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Cdk13Q69ZA1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cdk13Q69ZA1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cdk13Q69ZA1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cdk13Q69ZA1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cdk13Q69ZA1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cdk13Q69ZA1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cdk13Q69ZA1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cdk13Q69ZA1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Cdk13Q69ZA1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Cdk13Q69ZA1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Cdk13Q69ZA1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Cdk13Q69ZA1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Cdk13Q69ZA1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Cdk13Q69ZA1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Cdk13Q69ZA1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Cdk13Q69ZA1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Cdk13Q69ZA1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Cdk13Q69ZA1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Cdk13Q69ZA1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Cdk13Q69ZA1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Cdk13Q69ZA1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Cdk13Q69ZA1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Cdk13Q69ZA1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Cdk13Q69ZA1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Cdk13Q69ZA1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Cdk13Q69ZA1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Cdk13Q69ZA1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Cdk13Q69ZA1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Cdk13Q69ZA1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Cdk13Q69ZA1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Cdk13Q69ZA1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Cdk13Q69ZA1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Cdk13Q69ZA1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cdk13Q69ZA1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cdk13Q69ZA1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cdk13Q69ZA1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cdk13Q69ZA1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cdk13Q69ZA1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cdk13Q69ZA1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cdk13Q69ZA1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cdk13Q69ZA1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cdk13Q69ZA1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cdk13Q69ZA1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cdk13Q69ZA1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cdk13Q69ZA1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cdk13Q69ZA1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cdk13Q69ZA1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cdk13Q69ZA1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Cdk13Q69ZA1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Cdk13Q69ZA1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cdk13Q69ZA1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Cdk13Q69ZA1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cdk13Q69ZA1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cdk13Q69ZA1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cdk13Q69ZA1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cdk13Q69ZA1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cdk13Q69ZA1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cdk13Q69ZA1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Cdk13Q69ZA1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cdk13Q69ZA1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cdk13Q69ZA1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cdk13Q69ZA1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cdk13Q69ZA1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cdk13Q69ZA1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cdk13Q69ZA1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cdk13Q69ZA1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms