Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CltcQ68FD5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CltcQ68FD5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CltcQ68FD5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CltcQ68FD5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CltcQ68FD5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CltcQ68FD5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CltcQ68FD5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CltcQ68FD5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CltcQ68FD5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CltcQ68FD5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CltcQ68FD5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CltcQ68FD5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CltcQ68FD5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CltcQ68FD5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CltcQ68FD5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CltcQ68FD5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CltcQ68FD5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CltcQ68FD5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC31■■■□□ 2.55
CltcQ68FD5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CltcQ68FD5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CltcQ68FD5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CltcQ68FD5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CltcQ68FD5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CltcQ68FD5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CltcQ68FD5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CltcQ68FD5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CltcQ68FD5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CltcQ68FD5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CltcQ68FD5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CltcQ68FD5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CltcQ68FD5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CltcQ68FD5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CltcQ68FD5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CltcQ68FD5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
CltcQ68FD5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CltcQ68FD5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CltcQ68FD5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CltcQ68FD5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CltcQ68FD5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CltcQ68FD5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CltcQ68FD5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CltcQ68FD5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CltcQ68FD5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
CltcQ68FD5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CltcQ68FD5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CltcQ68FD5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CltcQ68FD5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CltcQ68FD5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CltcQ68FD5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CltcQ68FD5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CltcQ68FD5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CltcQ68FD5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CltcQ68FD5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
CltcQ68FD5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CltcQ68FD5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CltcQ68FD5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CltcQ68FD5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CltcQ68FD5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CltcQ68FD5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CltcQ68FD5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CltcQ68FD5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CltcQ68FD5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CltcQ68FD5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CltcQ68FD5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CltcQ68FD5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CltcQ68FD5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CltcQ68FD5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CltcQ68FD5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CltcQ68FD5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CltcQ68FD5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CltcQ68FD5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CltcQ68FD5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CltcQ68FD5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CltcQ68FD5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CltcQ68FD5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CltcQ68FD5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CltcQ68FD5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CltcQ68FD5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CltcQ68FD5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CltcQ68FD5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CltcQ68FD5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CltcQ68FD5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CltcQ68FD5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CltcQ68FD5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CltcQ68FD5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CltcQ68FD5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CltcQ68FD5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CltcQ68FD5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CltcQ68FD5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CltcQ68FD5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CltcQ68FD5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CltcQ68FD5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CltcQ68FD5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CltcQ68FD5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CltcQ68FD5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
CltcQ68FD5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CltcQ68FD5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
CltcQ68FD5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CltcQ68FD5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms