Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc8eQ66JT1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc8eQ66JT1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc8eQ66JT1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc8eQ66JT1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc8eQ66JT1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc8eQ66JT1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc8eQ66JT1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc8eQ66JT1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc8eQ66JT1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc8eQ66JT1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc8eQ66JT1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc8eQ66JT1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc8eQ66JT1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc8eQ66JT1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc8eQ66JT1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc8eQ66JT1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc8eQ66JT1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc8eQ66JT1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc8eQ66JT1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc8eQ66JT1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc8eQ66JT1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc8eQ66JT1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc8eQ66JT1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc8eQ66JT1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc8eQ66JT1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc8eQ66JT1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc8eQ66JT1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc8eQ66JT1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc8eQ66JT1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc8eQ66JT1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc8eQ66JT1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc8eQ66JT1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrc8eQ66JT1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrc8eQ66JT1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrc8eQ66JT1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lrrc8eQ66JT1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc8eQ66JT1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc8eQ66JT1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc8eQ66JT1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc8eQ66JT1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc8eQ66JT1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc8eQ66JT1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc8eQ66JT1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc8eQ66JT1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc8eQ66JT1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc8eQ66JT1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc8eQ66JT1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc8eQ66JT1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc8eQ66JT1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc8eQ66JT1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc8eQ66JT1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc8eQ66JT1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc8eQ66JT1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc8eQ66JT1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc8eQ66JT1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc8eQ66JT1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc8eQ66JT1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc8eQ66JT1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc8eQ66JT1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc8eQ66JT1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc8eQ66JT1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc8eQ66JT1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc8eQ66JT1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc8eQ66JT1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc8eQ66JT1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc8eQ66JT1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc8eQ66JT1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc8eQ66JT1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc8eQ66JT1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc8eQ66JT1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrc8eQ66JT1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrc8eQ66JT1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrc8eQ66JT1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrc8eQ66JT1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrc8eQ66JT1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrc8eQ66JT1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrc8eQ66JT1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrc8eQ66JT1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrrc8eQ66JT1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrrc8eQ66JT1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrrc8eQ66JT1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrrc8eQ66JT1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrrc8eQ66JT1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrrc8eQ66JT1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrrc8eQ66JT1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrrc8eQ66JT1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrrc8eQ66JT1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Lrrc8eQ66JT1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrc8eQ66JT1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrc8eQ66JT1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrc8eQ66JT1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrc8eQ66JT1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrc8eQ66JT1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrc8eQ66JT1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Lrrc8eQ66JT1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lrrc8eQ66JT1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lrrc8eQ66JT1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Lrrc8eQ66JT1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lrrc8eQ66JT1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms