Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Knl1Q66JQ7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Knl1Q66JQ7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Knl1Q66JQ7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Knl1Q66JQ7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Knl1Q66JQ7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Knl1Q66JQ7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Knl1Q66JQ7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Knl1Q66JQ7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Knl1Q66JQ7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Knl1Q66JQ7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Knl1Q66JQ7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Knl1Q66JQ7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Knl1Q66JQ7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Knl1Q66JQ7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Knl1Q66JQ7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Knl1Q66JQ7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Knl1Q66JQ7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Knl1Q66JQ7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Knl1Q66JQ7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Knl1Q66JQ7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Knl1Q66JQ7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Knl1Q66JQ7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Knl1Q66JQ7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Knl1Q66JQ7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Knl1Q66JQ7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Knl1Q66JQ7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Knl1Q66JQ7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Knl1Q66JQ7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Knl1Q66JQ7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Knl1Q66JQ7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Knl1Q66JQ7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Knl1Q66JQ7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Knl1Q66JQ7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Knl1Q66JQ7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Knl1Q66JQ7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Knl1Q66JQ7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Knl1Q66JQ7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Knl1Q66JQ7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Knl1Q66JQ7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Knl1Q66JQ7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Knl1Q66JQ7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Knl1Q66JQ7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Knl1Q66JQ7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Knl1Q66JQ7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Knl1Q66JQ7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Knl1Q66JQ7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Knl1Q66JQ7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Knl1Q66JQ7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Knl1Q66JQ7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Knl1Q66JQ7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Knl1Q66JQ7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Knl1Q66JQ7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Knl1Q66JQ7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Knl1Q66JQ7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Knl1Q66JQ7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Knl1Q66JQ7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Knl1Q66JQ7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Knl1Q66JQ7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Knl1Q66JQ7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Knl1Q66JQ7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Knl1Q66JQ7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Knl1Q66JQ7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Knl1Q66JQ7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Knl1Q66JQ7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Knl1Q66JQ7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Knl1Q66JQ7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Knl1Q66JQ7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Knl1Q66JQ7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Knl1Q66JQ7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Knl1Q66JQ7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Knl1Q66JQ7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Knl1Q66JQ7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Knl1Q66JQ7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Knl1Q66JQ7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Knl1Q66JQ7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Knl1Q66JQ7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Knl1Q66JQ7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Knl1Q66JQ7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Knl1Q66JQ7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Knl1Q66JQ7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Knl1Q66JQ7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Knl1Q66JQ7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Knl1Q66JQ7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Knl1Q66JQ7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Knl1Q66JQ7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Knl1Q66JQ7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Knl1Q66JQ7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Knl1Q66JQ7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Knl1Q66JQ7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Knl1Q66JQ7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Knl1Q66JQ7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Knl1Q66JQ7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Knl1Q66JQ7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Knl1Q66JQ7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Knl1Q66JQ7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Knl1Q66JQ7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Knl1Q66JQ7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Knl1Q66JQ7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Knl1Q66JQ7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms