Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VclQ64727 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VclQ64727 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VclQ64727 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VclQ64727 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VclQ64727 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VclQ64727 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VclQ64727 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VclQ64727 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VclQ64727 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VclQ64727 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
VclQ64727 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
VclQ64727 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VclQ64727 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VclQ64727 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
VclQ64727 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
VclQ64727 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VclQ64727 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VclQ64727 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VclQ64727 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VclQ64727 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
VclQ64727 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VclQ64727 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VclQ64727 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VclQ64727 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VclQ64727 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VclQ64727 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VclQ64727 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VclQ64727 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VclQ64727 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VclQ64727 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VclQ64727 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VclQ64727 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VclQ64727 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
VclQ64727 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VclQ64727 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VclQ64727 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VclQ64727 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VclQ64727 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VclQ64727 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VclQ64727 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
VclQ64727 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VclQ64727 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VclQ64727 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VclQ64727 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VclQ64727 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VclQ64727 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VclQ64727 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VclQ64727 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VclQ64727 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VclQ64727 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VclQ64727 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VclQ64727 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VclQ64727 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VclQ64727 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VclQ64727 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VclQ64727 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VclQ64727 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VclQ64727 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VclQ64727 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VclQ64727 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VclQ64727 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VclQ64727 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
VclQ64727 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VclQ64727 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VclQ64727 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
VclQ64727 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VclQ64727 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
VclQ64727 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
VclQ64727 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
VclQ64727 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VclQ64727 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VclQ64727 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VclQ64727 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VclQ64727 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VclQ64727 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VclQ64727 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VclQ64727 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VclQ64727 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VclQ64727 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VclQ64727 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VclQ64727 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VclQ64727 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VclQ64727 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VclQ64727 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VclQ64727 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VclQ64727 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VclQ64727 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VclQ64727 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VclQ64727 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VclQ64727 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VclQ64727 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VclQ64727 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VclQ64727 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VclQ64727 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VclQ64727 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VclQ64727 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VclQ64727 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VclQ64727 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VclQ64727 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms