Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pou4f3Q63955 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pou4f3Q63955 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pou4f3Q63955 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pou4f3Q63955 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Pou4f3Q63955 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Pou4f3Q63955 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pou4f3Q63955 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pou4f3Q63955 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pou4f3Q63955 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pou4f3Q63955 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pou4f3Q63955 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pou4f3Q63955 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pou4f3Q63955 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pou4f3Q63955 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou4f3Q63955 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou4f3Q63955 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou4f3Q63955 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou4f3Q63955 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou4f3Q63955 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou4f3Q63955 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou4f3Q63955 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou4f3Q63955 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou4f3Q63955 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou4f3Q63955 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou4f3Q63955 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou4f3Q63955 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Pou4f3Q63955 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pou4f3Q63955 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pou4f3Q63955 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pou4f3Q63955 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pou4f3Q63955 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pou4f3Q63955 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pou4f3Q63955 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pou4f3Q63955 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Pou4f3Q63955 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pou4f3Q63955 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pou4f3Q63955 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pou4f3Q63955 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pou4f3Q63955 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pou4f3Q63955 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pou4f3Q63955 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pou4f3Q63955 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pou4f3Q63955 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pou4f3Q63955 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pou4f3Q63955 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pou4f3Q63955 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pou4f3Q63955 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pou4f3Q63955 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pou4f3Q63955 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pou4f3Q63955 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pou4f3Q63955 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pou4f3Q63955 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pou4f3Q63955 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pou4f3Q63955 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pou4f3Q63955 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pou4f3Q63955 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pou4f3Q63955 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pou4f3Q63955 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pou4f3Q63955 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pou4f3Q63955 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou4f3Q63955 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou4f3Q63955 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou4f3Q63955 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou4f3Q63955 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou4f3Q63955 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou4f3Q63955 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou4f3Q63955 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou4f3Q63955 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou4f3Q63955 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou4f3Q63955 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou4f3Q63955 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou4f3Q63955 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou4f3Q63955 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou4f3Q63955 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou4f3Q63955 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou4f3Q63955 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou4f3Q63955 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou4f3Q63955 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou4f3Q63955 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou4f3Q63955 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou4f3Q63955 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou4f3Q63955 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou4f3Q63955 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou4f3Q63955 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou4f3Q63955 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou4f3Q63955 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou4f3Q63955 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou4f3Q63955 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou4f3Q63955 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou4f3Q63955 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou4f3Q63955 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou4f3Q63955 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou4f3Q63955 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou4f3Q63955 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou4f3Q63955 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pou4f3Q63955 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou4f3Q63955 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou4f3Q63955 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou4f3Q63955 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms