Protein–RNA interactions for Protein: Q62471

Lcn3, Vomeronasal secretory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn3Q62471 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lcn3Q62471 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lcn3Q62471 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lcn3Q62471 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lcn3Q62471 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lcn3Q62471 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lcn3Q62471 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lcn3Q62471 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lcn3Q62471 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lcn3Q62471 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lcn3Q62471 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lcn3Q62471 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lcn3Q62471 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lcn3Q62471 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lcn3Q62471 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lcn3Q62471 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lcn3Q62471 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lcn3Q62471 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lcn3Q62471 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lcn3Q62471 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lcn3Q62471 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lcn3Q62471 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lcn3Q62471 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lcn3Q62471 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lcn3Q62471 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lcn3Q62471 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lcn3Q62471 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lcn3Q62471 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lcn3Q62471 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lcn3Q62471 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lcn3Q62471 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lcn3Q62471 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lcn3Q62471 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lcn3Q62471 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lcn3Q62471 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lcn3Q62471 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lcn3Q62471 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lcn3Q62471 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lcn3Q62471 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lcn3Q62471 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lcn3Q62471 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lcn3Q62471 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lcn3Q62471 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lcn3Q62471 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lcn3Q62471 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lcn3Q62471 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lcn3Q62471 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lcn3Q62471 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lcn3Q62471 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lcn3Q62471 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lcn3Q62471 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lcn3Q62471 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lcn3Q62471 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lcn3Q62471 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lcn3Q62471 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lcn3Q62471 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lcn3Q62471 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lcn3Q62471 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lcn3Q62471 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lcn3Q62471 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lcn3Q62471 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lcn3Q62471 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lcn3Q62471 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lcn3Q62471 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lcn3Q62471 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lcn3Q62471 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lcn3Q62471 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lcn3Q62471 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lcn3Q62471 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lcn3Q62471 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lcn3Q62471 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lcn3Q62471 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lcn3Q62471 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lcn3Q62471 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lcn3Q62471 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lcn3Q62471 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lcn3Q62471 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lcn3Q62471 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lcn3Q62471 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lcn3Q62471 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lcn3Q62471 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lcn3Q62471 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lcn3Q62471 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lcn3Q62471 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lcn3Q62471 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lcn3Q62471 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lcn3Q62471 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lcn3Q62471 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lcn3Q62471 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lcn3Q62471 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lcn3Q62471 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lcn3Q62471 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lcn3Q62471 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lcn3Q62471 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lcn3Q62471 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lcn3Q62471 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lcn3Q62471 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lcn3Q62471 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lcn3Q62471 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lcn3Q62471 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms